28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4051 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4051  hypothetical protein  100 
 
 		 418 aa  815    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.749152  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0896  hypothetical protein  50.64 
 
 		 421 aa  133  6.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.08458  normal  0.380175 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6478  hypothetical protein  34.55 
 
 		 469 aa  64.3  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1435  putative virulence effector protein  28.22 
 
 		 402 aa  63.2  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1312  hypothetical protein  32.64 
 
 		 436 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00429215  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1948  hypothetical protein  36.84 
 
 		 669 aa  58.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247552  normal  0.114071 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1626  periplasmic copper-binding  28.69 
 
 		 899 aa  56.2  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0959099  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3213  hypothetical protein  37.5 
 
 		 385 aa  53.9  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1965  hypothetical protein  33.67 
 
 		 486 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2093  putative virulence effector protein  28.57 
 
 		 465 aa  50.1  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0566929  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2102  putative virulence effector protein  26.35 
 
 		 442 aa  49.7  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3027  signal peptide protein  36.67 
 
 		 282 aa  49.3  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0193368  normal  0.0163712 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3307  putative signal peptide protein  36.67 
 
 		 280 aa  48.9  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0281892 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2960  signal peptide protein  36.67 
 
 		 280 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0142734 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1539  hypothetical protein  35.04 
 
 		 597 aa  48.5  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1844  hypothetical protein  26.14 
 
 		 492 aa  47.4  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1954  hypothetical protein  26.14 
 
 		 517 aa  47  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.960644  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3155  hypothetical protein  25 
 
 		 513 aa  46.6  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0450583  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1708  ssrAB activated gene  29.13 
 
 		 441 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.483925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2108  ssrAB activated gene  31.07 
 
 		 460 aa  44.7  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52100  hypothetical protein  26.32 
 
 		 486 aa  45.1  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1748  ssrAB activated gene  29.13 
 
 		 442 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.135386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2633  hypothetical protein  24.73 
 
 		 451 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.270397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2381  putative virulence effector protein  26.62 
 
 		 461 aa  44.3  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.723161  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0471  hypothetical protein  26.14 
 
 		 454 aa  44.3  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1711  ssrAB activated gene  29.13 
 
 		 441 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1773  ssrAB activated gene  29.13 
 
 		 439 aa  43.1  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.420884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1567  ssrAB activated gene  29.13 
 
 		 439 aa  43.1  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>