16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2345 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2345  Lipocalin family protein  100 
 
 		 167 aa  321  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.039817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2077  Lipocalin family protein  83.83 
 
 		 166 aa  250  7e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00774456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0421  hypothetical protein  83.23 
 
 		 166 aa  248  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3826  Lipocalin-like  41.48 
 
 		 198 aa  96.7  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0515  Lipocalin family protein  35.66 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.10388 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2248  Lipocalin family protein  34.72 
 
 		 171 aa  72  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.385259 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0595  hypothetical protein  33.57 
 
 		 171 aa  70.9  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2187  Lipocalin-like  31.87 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.8223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1685  Lipocalin-like  33.33 
 
 		 368 aa  47.8  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0042  Lipocalin family protein  30.12 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.724852 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5037  outer membrane lipoprotein Blc, putative  35.29 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0356  lipoprotein Blc  36.23 
 
 		 189 aa  43.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0511  Lipocalin family protein  25.97 
 
 		 180 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4911  Lipocalin family protein  35.29 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1603  Lipocalin family protein  30.3 
 
 		 221 aa  42.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000130853  hitchhiker  0.0000767518 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0427  Lipocalin family protein  26.9 
 
 		 190 aa  40.4  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.861168  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>