17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1819 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1819  ERF family protein  100 
 
 		 245 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3034  ERF family protein  43.19 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3824  ERF family protein  40.99 
 
 		 244 aa  126  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3205  ERF family protein  41.5 
 
 		 249 aa  110  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0784  ERF  43.18 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235898 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3455  ERF family protein  39.36 
 
 		 252 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000562307 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3683  ERF family protein  34.2 
 
 		 284 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2344  ERF family protein  44.17 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.167517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5739  ERF family protein  29.15 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.189219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1923  ERF family protein  24.27 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011731  BbuZS7_P32  hypothetical protein  27.22 
 
 		 315 aa  51.2  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00000000903499  n/a   
 
 
-
 
NC_011736  BbuZS7_R29  erf family protein  27.22 
 
 		 315 aa  50.8  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.0000000144842  n/a   
 
 
-
 
NC_011720  BbuZS7_AC55  hypothetical protein  27.81 
 
 		 302 aa  47.8  0.0002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  unclonable  0.00000000000000167997  n/a   
 
 
-
 
NC_011735  BbuZS7_X29  erf family protein  29.87 
 
 		 338 aa  46.2  0.0005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.000034764  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0644  hypothetical protein  30.56 
 
 		 270 aa  43.1  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000408961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0582  hypothetical protein  30.56 
 
 		 270 aa  43.1  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000212372  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0565  hypothetical protein  24.5 
 
 		 224 aa  42.7  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>