11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3824 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3824  ERF family protein  100 
 
 		 244 aa  490  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3683  ERF family protein  49.79 
 
 		 284 aa  217  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3455  ERF family protein  54.49 
 
 		 252 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000562307 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0784  ERF  46.09 
 
 		 240 aa  165  8e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235898 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5739  ERF family protein  34.02 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.189219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1819  ERF family protein  40.99 
 
 		 245 aa  121  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3034  ERF family protein  33.47 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2344  ERF family protein  40.38 
 
 		 276 aa  88.2  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.167517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3205  ERF family protein  33.33 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1923  ERF family protein  29.11 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0565  hypothetical protein  31.45 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>