14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0565 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG0565  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  460  1e-129  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2600  ERF family protein  36.42 
 
 		 168 aa  99.4  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.303682 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4125  ERF family protein  44.96 
 
 		 202 aa  99  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.472309  hitchhiker  0.00000000689815 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3431  ERF family protein  36.88 
 
 		 273 aa  88.6  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2924  ERF family protein  36.25 
 
 		 273 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1270  single-stranded DNA-binding protein, ERF family  35.03 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.426792  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2344  ERF family protein  31.97 
 
 		 276 aa  58.5  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.167517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5739  ERF family protein  29.5 
 
 		 263 aa  55.1  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.189219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3824  ERF family protein  34.69 
 
 		 244 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0582  hypothetical protein  29.29 
 
 		 270 aa  49.7  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000212372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0644  hypothetical protein  29.29 
 
 		 270 aa  49.7  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000408961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1108  hypothetical protein  27.47 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.537256  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1923  ERF family protein  28.8 
 
 		 204 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3205  ERF family protein  28 
 
 		 249 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210814  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>