10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1923 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_1923  ERF family protein  100 
 
 		 204 aa  427  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5739  ERF family protein  40.61 
 
 		 263 aa  145  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.189219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3824  ERF family protein  29.11 
 
 		 244 aa  75.1  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3455  ERF family protein  32.76 
 
 		 252 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000562307 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0784  ERF  33.33 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235898 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3683  ERF family protein  34.23 
 
 		 284 aa  53.9  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1819  ERF family protein  23.9 
 
 		 245 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2344  ERF family protein  32.08 
 
 		 276 aa  48.9  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.167517  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0565  hypothetical protein  28.8 
 
 		 224 aa  48.1  0.00009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4125  ERF family protein  25.95 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.472309  hitchhiker  0.00000000689815 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>