10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3455 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3455  ERF family protein  100 
 
 		 252 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000562307 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3824  ERF family protein  54.49 
 
 		 244 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3683  ERF family protein  45.95 
 
 		 284 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0784  ERF  43.75 
 
 		 240 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235898 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5739  ERF family protein  32.82 
 
 		 263 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.189219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1819  ERF family protein  38.3 
 
 		 245 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3034  ERF family protein  32.69 
 
 		 263 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2344  ERF family protein  35.68 
 
 		 276 aa  89.7  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.167517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3205  ERF family protein  30.56 
 
 		 249 aa  75.1  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1923  ERF family protein  32.76 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>