11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3205 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3205  ERF family protein  100 
 
 		 249 aa  511  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2344  ERF family protein  62.25 
 
 		 276 aa  241  7e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.167517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1819  ERF family protein  41.18 
 
 		 245 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3034  ERF family protein  32.54 
 
 		 263 aa  99.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0784  ERF  35.8 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235898 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3824  ERF family protein  32.02 
 
 		 244 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5739  ERF family protein  32.94 
 
 		 263 aa  82  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.189219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3683  ERF family protein  30 
 
 		 284 aa  80.5  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3455  ERF family protein  30.06 
 
 		 252 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000562307 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1923  ERF family protein  30.16 
 
 		 204 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0565  hypothetical protein  29.01 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>