11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0784 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0784  ERF  100 
 
 		 240 aa  494  1e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235898 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3824  ERF family protein  46.88 
 
 		 244 aa  158  8e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3683  ERF family protein  40.36 
 
 		 284 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3455  ERF family protein  43.75 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000562307 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5739  ERF family protein  30.84 
 
 		 263 aa  119  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.189219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2344  ERF family protein  42.93 
 
 		 276 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.167517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1819  ERF family protein  43.18 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3205  ERF family protein  36.05 
 
 		 249 aa  92.4  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3034  ERF family protein  32.66 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1923  ERF family protein  32.54 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2600  ERF family protein  30 
 
 		 168 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.303682 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>