224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1439 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1439  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  246  5e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4122  hypothetical protein  91.55 
 
 		 206 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1839  transposase, IS4 family protein  91.55 
 
 		 206 aa  136  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.181674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0940  hypothetical protein  76.62 
 
 		 254 aa  120  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.2166  normal  0.359999 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2960  transposase, IS4 family protein  71.79 
 
 		 336 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0662876 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1815  transposase, IS4 family protein  71.79 
 
 		 190 aa  117  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0486007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1820  transposase, IS4 family protein  71.79 
 
 		 190 aa  117  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0796894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1805  transposase, IS4 family protein  71.79 
 
 		 190 aa  117  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2823  transposase, IS4 family protein  71.79 
 
 		 190 aa  117  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3795  hypothetical protein  71.79 
 
 		 190 aa  117  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3789  hypothetical protein  71.79 
 
 		 190 aa  117  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3849  hypothetical protein  71.79 
 
 		 190 aa  117  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0531772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3493  hypothetical protein  71.79 
 
 		 190 aa  117  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.887255  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3322  hypothetical protein  71.79 
 
 		 190 aa  117  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0338257  normal  0.289383 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0877  transposase, IS4 family protein  71.79 
 
 		 190 aa  117  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0937  transposase, IS4 family protein  71.79 
 
 		 190 aa  117  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119126  normal  0.651553 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1327  transposase, IS4 family protein  71.79 
 
 		 190 aa  117  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0861  transposase, IS4 family protein  70.51 
 
 		 190 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4294  hypothetical protein  71.05 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4288  hypothetical protein  71.05 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3823  hypothetical protein  71.05 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.375839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4300  hypothetical protein  71.05 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2133  transposase, IS4 family protein  71.05 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0173  transposase, IS4 family protein  71.05 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0829  transposase, IS4 family protein  71.05 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4638  transposase IS4 family protein  75.36 
 
 		 129 aa  114  6e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4650  transposase IS4 family protein  75.36 
 
 		 129 aa  114  6e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3697  IS66 Orf2 family protein  71.05 
 
 		 100 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.260233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3540  hypothetical protein  69.74 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.718907 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0506  IS4 family transposase  69.74 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1528  IS4 family transposase  69.74 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2758  IS4 family transposase  69.74 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3532  hypothetical protein  69.74 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00922044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3333  transposase, IS4 family protein  65.28 
 
 		 186 aa  109  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.505103 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5032  IS4 family transposase  72.46 
 
 		 129 aa  108  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.137379  normal  0.729645 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5037  IS4 family transposase  72.46 
 
 		 129 aa  108  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.505561  normal  0.915342 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2092  transposase, IS4 family protein  65.28 
 
 		 186 aa  108  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.663064  normal  0.152141 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2976  transposase, IS4 family protein  65.28 
 
 		 186 aa  108  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.119595 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2296  transposase  64.29 
 
 		 142 aa  105  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1006  transposase, IS4 family protein  65.22 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.733901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4093  transposase IS4 family protein  63.77 
 
 		 129 aa  104  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.550334  normal  0.402512 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4034  transposase IS4 family protein  63.77 
 
 		 129 aa  104  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.492844  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3758  transposase IS4 family protein  63.77 
 
 		 129 aa  104  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0586009  normal  0.260182 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0174  IS4 family transposase  60.87 
 
 		 129 aa  98.2  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4160  response regulator receiver protein  86 
 
 		 110 aa  91.3  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0535  IS5 family transposase orfB  52.86 
 
 		 146 aa  84.7  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0317  hypothetical protein  88.37 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.384563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2772  hypothetical protein  54.41 
 
 		 106 aa  82  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.407884  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0168  transposase, IS4 family protein  70.37 
 
 		 201 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4215  transposase, IS4  50 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0419  transposase IS4  54.39 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0597  transposase IS4  54.39 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0838  transposase IS4  54.39 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.463071  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1298  transposase IS4  54.39 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.618797  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1525  transposase IS4  54.39 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.742906  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1643  transposase IS4  54.39 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1645  transposase IS4  54.39 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1687  transposase IS4  54.39 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2027  transposase IS4  54.39 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2347  transposase IS4  54.39 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00020548  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2458  transposase IS4  54.39 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2606  transposase IS4  54.39 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1319  transposase IS4  57.41 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6451  hypothetical protein  42.86 
 
 		 273 aa  64.7  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112663  normal  0.335416 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  42.53 
 
 		 260 aa  64.7  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6151  hypothetical protein  41.67 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.777281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6259  hypothetical protein  41.67 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.147576 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0250  transposase IS4 family protein  42.86 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00554315  hitchhiker  0.00627953 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2677  transposase IS4 family protein  42.86 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183927  normal  0.153389 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0407  transposase, IS4  47.17 
 
 		 116 aa  60.1  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.789806  normal  0.45974 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3272  ISSod6, transposase  39.19 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0180  transposase, IS4  41.89 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.501437  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1015  transposase, IS4  41.89 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186494 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0773  ISSod6, transposase  39.19 
 
 		 252 aa  58.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1562  ISSod6, transposase  39.19 
 
 		 252 aa  58.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2732  ISSod6, transposase  39.19 
 
 		 252 aa  58.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2909  ISSod6 transposase  39.19 
 
 		 252 aa  58.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3478  ISSod6, transposase  39.19 
 
 		 252 aa  58.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0074  ISSod6, transposase  39.19 
 
 		 252 aa  58.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0426639  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0097  ISSod6, transposase  39.19 
 
 		 252 aa  58.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0162  ISSod6, transposase  39.19 
 
 		 252 aa  58.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.760495  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  40.85 
 
 		 251 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  40.85 
 
 		 251 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0807  transposase  41.43 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.478213  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1594  transposase  41.43 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2135  transposase  41.43 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3262  transposase  41.43 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09600  Transposase, IS4  33.78 
 
 		 245 aa  57.8  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0435  transposase, IS4  40.54 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1934  transposase, IS4  40.54 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4937  transposase, IS4 family protein  43.42 
 
 		 235 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00831349  normal  0.350186 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3841  transposase IS4 family protein  41.33 
 
 		 167 aa  57  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  42.47 
 
 		 260 aa  57  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  42.47 
 
 		 260 aa  57  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  42.47 
 
 		 260 aa  57  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  42.47 
 
 		 260 aa  57  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5636  hypothetical protein  41.33 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3783  hypothetical protein  41.33 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.155847 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  36.62 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  36.62 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>