73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3752 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3752  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  285  1e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2368  hypothetical protein  46.15 
 
 		 131 aa  125  3e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2285  hypothetical protein  50.41 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0451006  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1382  protein of unknown function DUF302  45.9 
 
 		 133 aa  122  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0692237  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3601  hypothetical protein  51.28 
 
 		 128 aa  121  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.108169 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3939  hypothetical protein  51.28 
 
 		 128 aa  121  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2890  hypothetical protein  42.96 
 
 		 128 aa  120  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0404  hypothetical protein  41.91 
 
 		 129 aa  114  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.658565  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0210  protein of unknown function DUF302  43.7 
 
 		 130 aa  114  6e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.279371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1108  protein of unknown function DUF302  47.58 
 
 		 128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.171345  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2269  hypothetical protein  45.11 
 
 		 128 aa  111  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228158  normal  0.126778 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4881  hypothetical protein  45.11 
 
 		 128 aa  111  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.489198 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2335  hypothetical protein  42.22 
 
 		 128 aa  110  5e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000793507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3053  hypothetical protein  44.44 
 
 		 129 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4400  hypothetical protein  46.28 
 
 		 128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.713122 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2156  hypothetical protein  44.35 
 
 		 131 aa  103  6e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.612651  normal  0.115283 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0540  hypothetical protein  47.54 
 
 		 135 aa  101  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.451768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5680  hypothetical protein  42.98 
 
 		 128 aa  100  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.18352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2073  protein of unknown function DUF302  44.26 
 
 		 131 aa  100  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2447  hypothetical protein  44.26 
 
 		 131 aa  100  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1910  hypothetical protein  45.95 
 
 		 114 aa  99.4  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.468377  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0981  hypothetical protein  40.74 
 
 		 131 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0925  protein of unknown function DUF302  40.5 
 
 		 131 aa  99.4  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4478  hypothetical protein  46.34 
 
 		 131 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3638  hypothetical protein  43.9 
 
 		 142 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5390  hypothetical protein  43.55 
 
 		 135 aa  97.4  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0504  hypothetical protein  43.55 
 
 		 135 aa  97.4  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.570987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5410  hypothetical protein  43.55 
 
 		 135 aa  97.4  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0277213 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1826  hypothetical protein  40.74 
 
 		 137 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.37864  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0833  protein of unknown function DUF302  45.79 
 
 		 141 aa  95.9  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.134961  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3677  hypothetical protein  40.74 
 
 		 137 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.134644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5312  hypothetical protein  40.74 
 
 		 137 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.849521  normal  0.398368 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5697  hypothetical protein  40 
 
 		 137 aa  94  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.141635  normal  0.71056 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0357  protein of unknown function DUF302  42.4 
 
 		 143 aa  93.6  9e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1892  protein of unknown function DUF302  41.23 
 
 		 134 aa  92  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3031  protein of unknown function DUF302  39.39 
 
 		 138 aa  90.9  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1964  protein of unknown function DUF302  37.29 
 
 		 280 aa  90.9  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0500  hypothetical protein  39.52 
 
 		 123 aa  90.1  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.227821  normal  0.547396 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3125  hypothetical protein  38.66 
 
 		 132 aa  90.1  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2575  protein of unknown function DUF302  40.8 
 
 		 144 aa  89.7  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000565546  decreased coverage  0.0000318285 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2724  protein of unknown function DUF302  37.82 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0628237  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1827  hypothetical protein  37.19 
 
 		 135 aa  89  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4248  hypothetical protein  38.21 
 
 		 133 aa  87  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.472325  normal  0.0489284 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4093  hypothetical protein  38.21 
 
 		 133 aa  87  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4018  hypothetical protein  38.21 
 
 		 133 aa  87  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0142  hypothetical protein  45.22 
 
 		 134 aa  86.7  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2260  protein of unknown function DUF302  34.75 
 
 		 280 aa  85.9  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0204221  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0138  protein of unknown function DUF302  36.17 
 
 		 135 aa  85.1  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0505  protein of unknown function DUF302  37.19 
 
 		 136 aa  84.3  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23213  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4042  protein of unknown function DUF302  37.6 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4074  protein of unknown function DUF302  37.6 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3686  hypothetical protein  35.59 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.829007  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3932  hypothetical protein  36.8 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2773  protein of unknown function DUF302  34.45 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0970  hypothetical protein  43.64 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000354639 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3831  hypothetical protein  46.32 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4222  protein of unknown function DUF302  40.24 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3468  hypothetical protein  31.45 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2611  protein of unknown function DUF302  39.47 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1112  protein of unknown function DUF302  35.63 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3325  protein of unknown function DUF302  34 
 
 		 146 aa  57  0.00000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.847441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0266  protein of unknown function DUF302  39.44 
 
 		 148 aa  57  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4277  protein of unknown function DUF302  36.36 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.486441  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1248  protein of unknown function DUF302  30.17 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0155671  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2887  protein of unknown function DUF302  26.61 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1263  hypothetical protein  30.15 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000191336  unclonable  0.00000000979436 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2906  hypothetical protein  22.96 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.594021 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2146  hypothetical protein  33.33 
 
 		 128 aa  47.4  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1946  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 154 aa  47  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2069  hypothetical protein  22.79 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1854  hypothetical protein  23.02 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2545  putative cytochrome c  23.2 
 
 		 350 aa  43.9  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2111  hypothetical protein  22.95 
 
 		 127 aa  40.4  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>