273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3605 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3605  Iron-sulfur cluster binding protein  100 
 
 		 472 aa  966    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0368  iron-sulfur cluster binding protein  64.67 
 
 		 478 aa  644    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1768  hypothetical protein  66.09 
 
 		 490 aa  638    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.215438  normal  0.0554235 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2897  hypothetical protein  62.72 
 
 		 473 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00038131  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3165  iron-sulfur cluster binding protein  58 
 
 		 475 aa  561  1e-158  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2281  iron-sulfur cluster binding protein  56.29 
 
 		 476 aa  553  1e-156  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1430  iron-sulfur cluster binding protein  57.52 
 
 		 482 aa  531  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.461528  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0459  iron-sulfur cluster-binding protein  57.3 
 
 		 477 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0556  iron-sulfur cluster binding protein  57.3 
 
 		 477 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2183  iron-sulfur cluster-binding protein  57.52 
 
 		 477 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0868  iron-sulfur cluster-binding protein  57.52 
 
 		 477 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.307451  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1874  iron-sulfur cluster binding protein  56.86 
 
 		 482 aa  527  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2079  iron-sulfur cluster binding protein  56.86 
 
 		 482 aa  524  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293755  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2925  iron-sulfur cluster binding protein  50.75 
 
 		 471 aa  467  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117393  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1311  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  50.43 
 
 		 470 aa  458  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1934  iron-sulfur cluster binding protein  49.68 
 
 		 469 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.628498  normal  0.020498 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1606  protein of unknown function DUF162  49.68 
 
 		 469 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.143052  normal  0.308482 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3588  iron-sulfur cluster binding protein  48.51 
 
 		 469 aa  456  1e-127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2167  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50.11 
 
 		 470 aa  455  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928776  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2040  hypothetical protein  50.54 
 
 		 470 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2147  hypothetical protein  50.11 
 
 		 470 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.68355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0559  hypothetical protein  50.32 
 
 		 488 aa  452  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.907474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5436  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  50.11 
 
 		 470 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0384157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1140  hypothetical protein  49.68 
 
 		 470 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344454  normal  0.667086 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1207  Iron-sulfur cluster binding protein  50 
 
 		 470 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5947  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  50.11 
 
 		 470 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2130  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50.11 
 
 		 470 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.350099  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1612  putative iron-sulfur binding protein  48.83 
 
 		 469 aa  450  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1463  hypothetical protein  48.39 
 
 		 470 aa  451  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2430  protein of unknown function DUF162  49.15 
 
 		 481 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.182223 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1548  putative iron-sulfur binding protein  49.57 
 
 		 471 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360609  normal  0.0421236 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2584  protein of unknown function DUF162  48.72 
 
 		 471 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31363  hitchhiker  0.000668194 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0670  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  47.51 
 
 		 480 aa  431  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.88512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1493  putative iron-sulfur cluster-binding protein  48.63 
 
 		 483 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3099  putative iron-sulfur cluster-binding protein  48.63 
 
 		 536 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.178742  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2603  iron-sulfur cluster binding protein  48.63 
 
 		 483 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.255424  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1712  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  48.63 
 
 		 483 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2221  putative iron-sulfur cluster-binding protein  48.63 
 
 		 483 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1871  iron-sulfur cluster binding protein  49.89 
 
 		 522 aa  428  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.287018  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2659  iron-sulfur cluster binding protein  48.63 
 
 		 483 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2737  iron-sulfur cluster binding protein  48.42 
 
 		 483 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1691  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.04 
 
 		 479 aa  419  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3262  iron-sulfur cluster-binding protein  43.13 
 
 		 470 aa  398  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3036  iron-sulfur cluster-binding protein  42.92 
 
 		 470 aa  396  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2957  iron-sulfur cluster-binding protein  43.13 
 
 		 470 aa  397  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3269  iron-sulfur cluster-binding protein  42.92 
 
 		 470 aa  396  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2719  iron-sulfur cluster binding protein  43.95 
 
 		 473 aa  374  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0391  iron-sulfur cluster binding protein  40.99 
 
 		 475 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4459  iron-sulfur cluster binding protein  43.34 
 
 		 470 aa  367  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0710  hypothetical protein  38.96 
 
 		 470 aa  367  1e-100  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0817  iron-sulfur cluster binding protein  41.43 
 
 		 464 aa  364  2e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.244426  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2769  iron-sulfur cluster binding protein  40.13 
 
 		 475 aa  363  5.0000000000000005e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0716  iron-sulfur cluster binding protein  44.59 
 
 		 472 aa  362  9e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37070  (4Fe-4S) cluster-containing protein  43.4 
 
 		 475 aa  361  2e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621566  normal  0.014795 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1233  iron-sulfur cluster binding protein  39.74 
 
 		 473 aa  361  2e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.318042  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2994  Iron-sulfur cluster binding protein  42.4 
 
 		 489 aa  360  2e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1095  iron-sulfur cluster binding protein  41.25 
 
 		 463 aa  360  2e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1273  iron-sulfur cluster binding protein  39.58 
 
 		 476 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0811  iron-sulfur cluster binding protein  42.68 
 
 		 470 aa  354  2e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.016821 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1748  iron-sulfur cluster binding protein  40.13 
 
 		 474 aa  354  2e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.131347  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00263  predicted amino acid dehydrogenase with NAD(P)-binding domain and ferridoxin-like domain  38.41 
 
 		 475 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3298  iron-sulfur cluster binding protein  38.41 
 
 		 475 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1754  iron-sulfur cluster binding protein  43.74 
 
 		 512 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.258831  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0339  iron-sulfur cluster binding protein  38.2 
 
 		 475 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00267  hypothetical protein  38.41 
 
 		 475 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3315  iron-sulfur cluster binding protein  38.41 
 
 		 475 aa  353  4e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0322  iron-sulfur cluster binding protein  38.2 
 
 		 475 aa  350  2e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0360  iron-sulfur cluster binding protein  38.2 
 
 		 475 aa  351  2e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.400129 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0360  iron-sulfur cluster binding protein  38.2 
 
 		 475 aa  350  2e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.53651  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1716  iron-sulfur cluster binding protein  41.7 
 
 		 479 aa  350  3e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1217  iron-sulfur cluster binding protein  42.43 
 
 		 481 aa  348  1e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.49103  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2678  iron-sulfur cluster binding protein  38.33 
 
 		 473 aa  348  1e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0258  iron-sulfur cluster binding protein  37.55 
 
 		 475 aa  347  2e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43090  iron-sulfur cluster binding protein-like protein  39.14 
 
 		 482 aa  345  8e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3244  iron-sulfur cluster binding protein  42.24 
 
 		 479 aa  345  1e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.968259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3103  iron-sulfur cluster binding protein  41.56 
 
 		 490 aa  344  2e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0751  Iron-sulfur cluster binding protein  39.04 
 
 		 484 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1033  iron-sulfur cluster binding protein  41.83 
 
 		 493 aa  342  8e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.768116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5227  iron-sulfur cluster binding protein  41.83 
 
 		 493 aa  342  8e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3562  iron-sulfur cluster binding protein  41.83 
 
 		 501 aa  342  1e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0176735  hitchhiker  0.00702325 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4816  iron-sulfur cluster binding protein  42.17 
 
 		 479 aa  341  1e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1417  iron-sulfur cluster-binding protein  36.65 
 
 		 473 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1217  iron-sulfur cluster-binding protein  36.65 
 
 		 473 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.387258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1195  iron-sulfur cluster-binding protein  36.65 
 
 		 473 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1197  iron-sulfur cluster-binding protein  36.65 
 
 		 473 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.208704  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1316  iron-sulfur cluster-binding protein  36.65 
 
 		 473 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1457  iron-sulfur cluster-binding protein  36.65 
 
 		 473 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1025  iron-sulfur cluster-binding protein  36.65 
 
 		 473 aa  340  4e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1376  iron-sulfur cluster binding protein  40.55 
 
 		 475 aa  339  5e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.204617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1843  Iron-sulfur cluster binding protein  40.12 
 
 		 480 aa  339  5.9999999999999996e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000340116  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1393  iron-sulfur cluster-binding protein  36.65 
 
 		 473 aa  339  8e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3989  iron-sulfur cluster-binding protein  36.65 
 
 		 473 aa  338  9e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.638276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1355  iron-sulfur cluster-binding protein  36.65 
 
 		 473 aa  338  9e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5376  iron-sulfur cluster binding protein  41.82 
 
 		 481 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.75829 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1219  iron-sulfur cluster binding protein  36.44 
 
 		 473 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.394191  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1412  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  43.01 
 
 		 484 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0326413  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1764  Iron-sulfur cluster binding protein  39.53 
 
 		 480 aa  336  5e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0080  iron-sulfur cluster binding protein  41.26 
 
 		 475 aa  336  5e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.157943  unclonable  0.0000167452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7369  iron-sulfur cluster binding protein  42.04 
 
 		 470 aa  336  5.999999999999999e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0968  iron-sulfur cluster binding protein  38.31 
 
 		 476 aa  334  2e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>