32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3026 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A3026  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  100 
 
 
340 aa  659    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2339  HPr kinase  27.53 
 
 
325 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0970084 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1280  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  32.12 
 
 
323 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0820  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  33.67 
 
 
301 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1478  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  35.55 
 
 
330 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2661  hypothetical protein  29.11 
 
 
296 aa  109  6e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0700919  decreased coverage  0.00119506 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0056  HPr kinase  31.34 
 
 
301 aa  105  9e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1464  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  30.36 
 
 
300 aa  103  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3276  HPr kinase  27.34 
 
 
316 aa  102  9e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3385  HPr kinase  24.49 
 
 
324 aa  95.1  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.448245  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1352  hypothetical protein  30.33 
 
 
268 aa  87.4  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2007  HPr kinase  33.33 
 
 
301 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.618499 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0966  hypothetical protein  33.62 
 
 
317 aa  84  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1025  HPr kinase  33.49 
 
 
322 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.205108 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1353  hypothetical protein  34.48 
 
 
302 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2954  HPr kinase  29.29 
 
 
329 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.134566  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0851  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  30.74 
 
 
347 aa  73.2  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5037  HPr kinase  27.32 
 
 
313 aa  72.8  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0853  hypothetical protein  34.64 
 
 
361 aa  68.6  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26991  hypothetical protein  27.08 
 
 
302 aa  67.4  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4549  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  27.04 
 
 
323 aa  64.3  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.123281 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0856  hypothetical protein  35.54 
 
 
301 aa  63.9  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.265376  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1217  HPr kinase  29.24 
 
 
306 aa  60.1  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0169089  normal  0.100415 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2830  HPr kinase  42.86 
 
 
325 aa  59.7  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2558  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  29.24 
 
 
306 aa  59.3  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3244  HPr kinase  26.8 
 
 
286 aa  55.5  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4502  HPr kinase  31.67 
 
 
313 aa  53.9  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1964  HPr kinase  30.41 
 
 
307 aa  53.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.447407 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4906  HPr kinase  21.49 
 
 
298 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0668062  normal  0.137945 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2827  hypothetical protein  35.79 
 
 
341 aa  50.1  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1373  HPr kinase  29.59 
 
 
330 aa  45.8  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.401214  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2049  HPr kinase  40.68 
 
 
148 aa  44.3  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.824494  normal  0.123251 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>