17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2211 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2211  porin  100 
 
 		 362 aa  718    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2212  hypothetical protein  68.16 
 
 		 348 aa  462  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.541863  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1282  porin  32.41 
 
 		 377 aa  127  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  33.6 
 
 		 381 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4301  hypothetical protein  24.92 
 
 		 493 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0574645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  27.56 
 
 		 380 aa  50.1  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  27.56 
 
 		 380 aa  50.1  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  32.28 
 
 		 379 aa  48.5  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0413  hypothetical protein  30.88 
 
 		 336 aa  47.8  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.343551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6355  porin  24.6 
 
 		 398 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.289379 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3454  porin  23.77 
 
 		 315 aa  47.4  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0284932  hitchhiker  0.000170236 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6767  outer membrane protein (porin)-like  27.54 
 
 		 370 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0380133  normal  0.91585 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3938  porin  31.58 
 
 		 363 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2769  porin  25.92 
 
 		 314 aa  44.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0218371  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2569  porin  28.87 
 
 		 365 aa  45.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000000237522  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  26.92 
 
 		 383 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  26.92 
 
 		 374 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>