8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2212 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2212  hypothetical protein  100 
 
 		 348 aa  692    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.541863  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2211  porin  68.16 
 
 		 362 aa  443  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1282  porin  30.11 
 
 		 377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1295  porin  25.15 
 
 		 316 aa  47.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000017597  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0445  hypothetical protein  23.7 
 
 		 382 aa  47  0.0005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0213491  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4301  hypothetical protein  24.19 
 
 		 493 aa  46.6  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0574645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1725  porin  25.91 
 
 		 348 aa  45.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3454  porin  24.34 
 
 		 315 aa  43.5  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0284932  hitchhiker  0.000170236 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>