78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1967 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1967  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  100 
 
 		 463 aa  909    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0177733  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4393  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.39 
 
 		 690 aa  267  2.9999999999999995e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.550046 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3716  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40 
 
 		 524 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.338967 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1088  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.25 
 
 		 494 aa  181  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0373  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  25.27 
 
 		 479 aa  62.8  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.443347 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4226  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.71 
 
 		 1454 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.542738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3587  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.36 
 
 		 599 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1086  intracellular serine protease  28.35 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1626  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.68 
 
 		 432 aa  57.8  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000205027 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1604  hypothetical protein  21.38 
 
 		 531 aa  57  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.103561  normal  0.895852 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3892  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.96 
 
 		 295 aa  56.2  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000195035  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19260  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.07 
 
 		 443 aa  56.2  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.775766  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3412  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.56 
 
 		 453 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0271  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.2 
 
 		 807 aa  55.1  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00769668 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0314  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.65 
 
 		 805 aa  55.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000378195 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3123  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.69 
 
 		 640 aa  54.3  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00188421  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0653  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.89 
 
 		 360 aa  52.8  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1904  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.87 
 
 		 548 aa  52.4  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3010  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.26 
 
 		 726 aa  52.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1050  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.47 
 
 		 413 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.141106  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1449  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.6 
 
 		 446 aa  51.6  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0023  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.07 
 
 		 1008 aa  51.2  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.421595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22270  subtilisin-like serine protease  26.09 
 
 		 405 aa  51.2  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0324587  normal  0.352098 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1052  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.71 
 
 		 1052 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.865489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1437  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.19 
 
 		 425 aa  50.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.948372  normal  0.0800108 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3062  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.17 
 
 		 327 aa  50.4  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521678  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2279  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.2 
 
 		 589 aa  49.3  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0796  serine protease  32.88 
 
 		 400 aa  49.3  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.666057 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1188  FHA domain-containing protein  26.69 
 
 		 541 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00110568  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0816  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  40.59 
 
 		 721 aa  48.9  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2930  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.53 
 
 		 453 aa  49.3  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3197  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.3 
 
 		 749 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0061261  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3756  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.84 
 
 		 601 aa  47.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.652103  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  24.61 
 
 		 983 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2773  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.93 
 
 		 997 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0362893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0689  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  24.23 
 
 		 464 aa  47.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0305  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.58 
 
 		 1451 aa  47.4  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1249  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  24.74 
 
 		 431 aa  47  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.613624  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1878  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  27.79 
 
 		 451 aa  47.4  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.597803  normal  0.61636 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0931  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.27 
 
 		 500 aa  47  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2169  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.06 
 
 		 818 aa  47  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1928  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.03 
 
 		 452 aa  47  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1192  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.69 
 
 		 417 aa  47  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0468  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  28.4 
 
 		 860 aa  46.2  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1099  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  22.77 
 
 		 495 aa  46.2  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0536343  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2600  subtilisin-like serine protease-like  24.05 
 
 		 1315 aa  46.2  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0639979  normal  0.124831 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1555  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.93 
 
 		 1078 aa  46.6  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11414  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05170  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.96 
 
 		 653 aa  46.2  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0257  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.48 
 
 		 449 aa  46.6  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1388  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.73 
 
 		 444 aa  46.2  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.196735  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4314  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.69 
 
 		 431 aa  45.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.106523 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2829  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.21 
 
 		 999 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0476517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5792  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  28.48 
 
 		 1285 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193425  normal  0.237593 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3544  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.39 
 
 		 711 aa  45.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0365  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.26 
 
 		 487 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1052  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.84 
 
 		 423 aa  45.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.223191  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0605  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.95 
 
 		 431 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0783  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.73 
 
 		 597 aa  44.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0995  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  26.58 
 
 		 398 aa  45.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.818961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5326  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.38 
 
 		 398 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8473  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.96 
 
 		 417 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2404  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.15 
 
 		 925 aa  44.7  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0146269  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0364  subtilisin-like serine protease-like  26.04 
 
 		 692 aa  44.7  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.75506  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4203  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  26.76 
 
 		 1333 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5318  hitchhiker  0.00171277 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2657  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.47 
 
 		 627 aa  44.3  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3342  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.25 
 
 		 966 aa  43.9  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2827  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.21 
 
 		 453 aa  43.9  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0089  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.88 
 
 		 368 aa  43.9  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1788  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.17 
 
 		 635 aa  43.9  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0368  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.32 
 
 		 1453 aa  43.9  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.120671 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0298  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  21.21 
 
 		 320 aa  43.9  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000146885  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0488  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.82 
 
 		 577 aa  43.9  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.718847  normal  0.491604 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0265  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  21.21 
 
 		 320 aa  43.9  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3497  hypothetical protein  25.36 
 
 		 1170 aa  43.5  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5412  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.56 
 
 		 404 aa  43.5  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0682  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  25.46 
 
 		 349 aa  43.1  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.10054 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1417  serine metalloprotease MrpA  26.9 
 
 		 560 aa  43.1  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.620558  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3304  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.63 
 
 		 1706 aa  43.1  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.876918  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>