More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1140 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2248  elongation factor G  52.54 
 
 		 670 aa  699    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.456219 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4806  elongation factor G  49.78 
 
 		 683 aa  651    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2978  elongation factor G  48.52 
 
 		 696 aa  637    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.493994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3294  elongation factor G  54.32 
 
 		 680 aa  702    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2247  elongation factor G  52.48 
 
 		 669 aa  697    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.040202  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3762  elongation factor G  53.71 
 
 		 681 aa  726    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0675022 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1365  elongation factor G  52.71 
 
 		 678 aa  702    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0359186 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0279  small GTP-binding protein  53.08 
 
 		 676 aa  676    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1140  elongation factor G  100 
 
 		 671 aa  1363    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1300  elongation factor G  49.34 
 
 		 688 aa  652    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.196732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3921  elongation factor G  49.63 
 
 		 683 aa  649    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1634  elongation factor G  53.1 
 
 		 675 aa  689    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.100311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2771  elongation factor G  51.12 
 
 		 688 aa  694    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.252482  normal  0.08809 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0922  elongation factor G  52.63 
 
 		 667 aa  699    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.122297  normal  0.0871733 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1336  elongation factor G  52.56 
 
 		 678 aa  701    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4119  elongation factor G  48.06 
 
 		 682 aa  631  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.390379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1106  elongation factor G  47.7 
 
 		 699 aa  628  1e-178  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.67028  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5941  elongation factor G  47.26 
 
 		 678 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0130672  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1805  elongation factor G  47.09 
 
 		 655 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.504417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2082  elongation factor G  51.34 
 
 		 662 aa  603  1.0000000000000001e-171  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0399925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2110  elongation factor G  47.61 
 
 		 671 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5234  elongation factor G  47.11 
 
 		 678 aa  597  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00485318 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1277  elongation factor G  45.91 
 
 		 686 aa  587  1e-166  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.836232  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1818  elongation factor G  45.23 
 
 		 642 aa  571  1e-161  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237158 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0543  elongation factor G  43.54 
 
 		 660 aa  535  1e-150  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.934068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2751  elongation factor G  44.31 
 
 		 661 aa  513  1e-144  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4086  elongation factor G  36.95 
 
 		 653 aa  427  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.639909 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5899  elongation factor G  36.23 
 
 		 653 aa  420  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  32.54 
 
 		 692 aa  370  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  33.48 
 
 		 691 aa  369  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  32.7 
 
 		 695 aa  370  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  32.45 
 
 		 694 aa  368  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  34.91 
 
 		 673 aa  367  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  35.25 
 
 		 680 aa  363  5.0000000000000005e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1486  elongation factor G  34.22 
 
 		 695 aa  362  2e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000303107  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  30.99 
 
 		 696 aa  360  4e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  30.85 
 
 		 696 aa  358  1.9999999999999998e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  33.53 
 
 		 692 aa  355  1e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  34.31 
 
 		 690 aa  353  4e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  33.04 
 
 		 691 aa  353  4e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0188  elongation factor G  31.49 
 
 		 693 aa  351  3e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000059659  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  32.7 
 
 		 701 aa  349  9e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  33.14 
 
 		 682 aa  349  1e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  32.22 
 
 		 697 aa  348  3e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09730  translation elongation factor G  33.04 
 
 		 688 aa  346  6e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  31.67 
 
 		 695 aa  347  6e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  32.26 
 
 		 701 aa  347  6e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  31.65 
 
 		 679 aa  343  4e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  32.6 
 
 		 694 aa  342  9e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  31.64 
 
 		 689 aa  341  2e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  32.17 
 
 		 691 aa  340  4e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2021  elongation factor G  31.53 
 
 		 691 aa  340  7e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  32.32 
 
 		 692 aa  340  7e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  31.99 
 
 		 689 aa  340  7e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  31.81 
 
 		 692 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0222  translation elongation factor G  32.95 
 
 		 689 aa  337  2.9999999999999997e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0488172  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2537  small GTP-binding protein  31.64 
 
 		 697 aa  338  2.9999999999999997e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0128296  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2910  translation elongation factor G  31.78 
 
 		 695 aa  337  5e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00946616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2622  translation elongation factor G  32.79 
 
 		 697 aa  337  5.999999999999999e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000402697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2909  elongation factor G  33.14 
 
 		 686 aa  335  1e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0321  elongation factor G  31.59 
 
 		 691 aa  335  1e-90  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0832332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2741  elongation factor G  33.13 
 
 		 686 aa  335  1e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.784554  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  31.09 
 
 		 697 aa  335  2e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1601  elongation factor G  30.78 
 
 		 691 aa  335  2e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  32.18 
 
 		 692 aa  334  4e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0289  elongation factor G  31.51 
 
 		 698 aa  334  4e-90  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000225468  unclonable  2.3107599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2098  small GTP-binding protein  34.38 
 
 		 656 aa  333  6e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17001  elongation factor G  30.51 
 
 		 691 aa  333  6e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23631  elongation factor G  30.94 
 
 		 691 aa  333  6e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.221598 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0204  small GTP-binding protein  31 
 
 		 682 aa  332  1e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153237  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1785  elongation factor G  33.38 
 
 		 687 aa  332  1e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4324  translation elongation factor G  31.85 
 
 		 703 aa  331  2e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2318  small GTP-binding protein domain-containing protein  32.84 
 
 		 682 aa  332  2e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1933  elongation factor G  30.99 
 
 		 697 aa  331  3e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0407442  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  32.29 
 
 		 696 aa  331  3e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17121  elongation factor G  30.36 
 
 		 691 aa  331  3e-89  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.668762  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  32.03 
 
 		 692 aa  330  5.0000000000000004e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  32.12 
 
 		 689 aa  330  7e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2931  elongation factor G  32.79 
 
 		 688 aa  329  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400395 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1314  elongation factor G  32.75 
 
 		 702 aa  328  1.0000000000000001e-88  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00915512  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0570  elongation factor G  30.26 
 
 		 693 aa  328  2.0000000000000001e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  32.44 
 
 		 670 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1985  elongation factor G  30.26 
 
 		 697 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.786263  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1141  elongation factor G  32.31 
 
 		 691 aa  328  2.0000000000000001e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000161111  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0419  elongation factor G  31.3 
 
 		 692 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000206577  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1937  elongation factor G  32.22 
 
 		 685 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1022  elongation factor G  32.15 
 
 		 683 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0656  elongation factor G  30.66 
 
 		 694 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0584  elongation factor G  30.26 
 
 		 693 aa  328  2.0000000000000001e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000768044  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  31.02 
 
 		 692 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16891  elongation factor G  31.16 
 
 		 691 aa  327  3e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.900412  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1187  translation elongation factor G  32.11 
 
 		 688 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000405339  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  32.37 
 
 		 692 aa  326  8.000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  32.23 
 
 		 692 aa  326  1e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  32.34 
 
 		 673 aa  326  1e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  31.84 
 
 		 696 aa  325  1e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4111  small GTP-binding protein  32.52 
 
 		 697 aa  324  3e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00902379 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16321  elongation factor G  30.49 
 
 		 691 aa  324  3e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  30.04 
 
 		 691 aa  323  5e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  31.91 
 
 		 692 aa  323  5e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>