More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0404 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0405  amidophosphoribosyltransferase  66.8 
 
 		 493 aa  658    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2878  amidophosphoribosyltransferase  64.35 
 
 		 517 aa  641    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.116336 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0404  amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 		 488 aa  1001    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305555  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3487  amidophosphoribosyltransferase  64.33 
 
 		 503 aa  647    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.746658  normal  0.621078 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1541  amidophosphoribosyltransferase  61.8 
 
 		 502 aa  632  1e-180  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4300  amidophosphoribosyltransferase  64.71 
 
 		 491 aa  630  1e-179  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.182299  normal  0.0484415 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3894  amidophosphoribosyltransferase  63.22 
 
 		 491 aa  629  1e-179  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3932  amidophosphoribosyltransferase  64.71 
 
 		 491 aa  630  1e-179  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.961822  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0983  amidophosphoribosyltransferase  63.14 
 
 		 490 aa  630  1e-179  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.592161  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4407  amidophosphoribosyltransferase  64.77 
 
 		 491 aa  628  1e-179  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2311  amidophosphoribosyltransferase  64.71 
 
 		 501 aa  625  1e-178  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.672659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2599  amidophosphoribosyltransferase  62.45 
 
 		 499 aa  621  1e-176  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0391838  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0578  amidophosphoribosyltransferase  61.09 
 
 		 486 aa  619  1e-176  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4629  amidophosphoribosyltransferase  61.76 
 
 		 500 aa  615  1e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691036  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1763  amidophosphoribosyltransferase  60.87 
 
 		 496 aa  617  1e-175  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.644721  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2997  amidophosphoribosyltransferase  63.92 
 
 		 514 aa  614  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.807987  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2502  amidophosphoribosyltransferase  62.13 
 
 		 500 aa  612  9.999999999999999e-175  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2400  amidophosphoribosyltransferase  61.18 
 
 		 514 aa  609  1e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.453817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3501  amidophosphoribosyltransferase  62.45 
 
 		 509 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3939  amidophosphoribosyltransferase  59.25 
 
 		 499 aa  599  1e-170  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2282  amidophosphoribosyltransferase  61.6 
 
 		 503 aa  596  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.235461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0413  amidophosphoribosyltransferase  61.19 
 
 		 491 aa  593  1e-168  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.577853 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1042  amidophosphoribosyltransferase  59.39 
 
 		 496 aa  594  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.236184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1062  amidophosphoribosyltransferase  57.26 
 
 		 486 aa  586  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.739126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2452  amidophosphoribosyltransferase  63.5 
 
 		 514 aa  586  1e-166  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3787  amidophosphoribosyltransferase  61.01 
 
 		 510 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1187  amidophosphoribosyltransferase  58.78 
 
 		 496 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.44974 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2454  amidophosphoribosyltransferase  56.73 
 
 		 487 aa  580  1e-164  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1499  amidophosphoribosyltransferase  60.3 
 
 		 529 aa  579  1e-164  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.338535  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1117  amidophosphoribosyltransferase  56.73 
 
 		 487 aa  580  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.981489  normal  0.353735 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2132  amidophosphoribosyltransferase  57.58 
 
 		 508 aa  576  1.0000000000000001e-163  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.864953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0560  amidophosphoribosyltransferase  57.92 
 
 		 496 aa  574  1.0000000000000001e-162  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.605887  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1707  amidophosphoribosyltransferase  58.19 
 
 		 497 aa  573  1.0000000000000001e-162  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0317953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2017  amidophosphoribosyltransferase  59.56 
 
 		 504 aa  569  1e-161  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0727  amidophosphoribosyltransferase  57.88 
 
 		 496 aa  571  1e-161  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2293  amidophosphoribosyltransferase  60.12 
 
 		 504 aa  567  1e-160  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0486  amidophosphoribosyltransferase  56.94 
 
 		 496 aa  557  1e-157  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.937235  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0446  amidophosphoribosyltransferase  58.33 
 
 		 485 aa  551  1e-155  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1205  amidophosphoribosyltransferase  55.49 
 
 		 493 aa  549  1e-155  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0453  amidophosphoribosyltransferase  58.18 
 
 		 509 aa  549  1e-155  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0265  amidophosphoribosyltransferase  56.88 
 
 		 476 aa  539  9.999999999999999e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1109  amidophosphoribosyltransferase  55.34 
 
 		 461 aa  532  1e-150  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1326  amidophosphoribosyltransferase  54.63 
 
 		 468 aa  534  1e-150  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2064  amidophosphoribosyltransferase  56.96 
 
 		 475 aa  526  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2702  amidophosphoribosyltransferase  54.77 
 
 		 475 aa  526  1e-148  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2329  amidophosphoribosyltransferase  53.03 
 
 		 477 aa  526  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.64237  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1722  amidophosphoribosyltransferase  56.96 
 
 		 481 aa  526  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.56305  normal  0.196104 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1891  amidophosphoribosyltransferase  53.25 
 
 		 477 aa  526  1e-148  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1636  amidophosphoribosyltransferase  54.44 
 
 		 467 aa  524  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1939  amidophosphoribosyltransferase  54.44 
 
 		 466 aa  523  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0139  amidophosphoribosyltransferase  54.49 
 
 		 462 aa  523  1e-147  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2068  amidophosphoribosyltransferase  53.11 
 
 		 474 aa  520  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.286768  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1153  amidophosphoribosyltransferase  53.88 
 
 		 474 aa  520  1e-146  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4361  amidophosphoribosyltransferase  54.77 
 
 		 485 aa  504  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4338  amidophosphoribosyltransferase  54.77 
 
 		 485 aa  504  1e-141  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0090  amidophosphoribosyltransferase  53.73 
 
 		 462 aa  499  1e-140  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4206  amidophosphoribosyltransferase  54.36 
 
 		 485 aa  500  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.975393  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4621  amidophosphoribosyltransferase  52.03 
 
 		 482 aa  500  1e-140  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.059877  normal  0.48412 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4354  amidophosphoribosyltransferase  55.72 
 
 		 484 aa  497  1e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.463043 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0321  amidophosphoribosyltransferase  49.67 
 
 		 461 aa  488  1e-136  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1871  amidophosphoribosyltransferase  51.97 
 
 		 451 aa  483  1e-135  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.10696  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3699  amidophosphoribosyltransferase  51.49 
 
 		 493 aa  481  1e-134  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.549743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1102  amidophosphoribosyltransferase  52.69 
 
 		 466 aa  481  1e-134  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1448  amidophosphoribosyltransferase  51.31 
 
 		 474 aa  481  1e-134  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1475  amidophosphoribosyltransferase  51.41 
 
 		 472 aa  478  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4178  amidophosphoribosyltransferase  50.94 
 
 		 494 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1778  hypothetical protein  49.89 
 
 		 475 aa  473  1e-132  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000929805  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4217  amidophosphoribosyltransferase  50.94 
 
 		 494 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2807  amidophosphoribosyltransferase  49.12 
 
 		 462 aa  473  1e-132  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0260  amidophosphoribosyltransferase  53.54 
 
 		 470 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0007  amidophosphoribosyltransferase  50.43 
 
 		 487 aa  469  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1249  amidophosphoribosyltransferase  49.37 
 
 		 488 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.917797  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1136  amidophosphoribosyltransferase  52.33 
 
 		 470 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4318  amidophosphoribosyltransferase  50.53 
 
 		 496 aa  467  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22120  amidophosphoribosyltransferase  50.77 
 
 		 480 aa  463  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.357347  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0334  amidophosphoribosyltransferase  49.56 
 
 		 462 aa  462  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.708549  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2047  amidophosphoribosyltransferase  53.1 
 
 		 465 aa  463  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.330153 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2307  amidophosphoribosyltransferase  48.14 
 
 		 467 aa  463  1e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3212  amidophosphoribosyltransferase  49.67 
 
 		 463 aa  463  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.903412  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0324  amidophosphoribosyltransferase  50.43 
 
 		 471 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0282  amidophosphoribosyltransferase  50.43 
 
 		 471 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0267  amidophosphoribosyltransferase  50.43 
 
 		 471 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0270  amidophosphoribosyltransferase  50.43 
 
 		 471 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2365  amidophosphoribosyltransferase  51.29 
 
 		 474 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0295  amidophosphoribosyltransferase  50.43 
 
 		 471 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.312701  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  50.77 
 
 		 469 aa  461  9.999999999999999e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0327  amidophosphoribosyltransferase  50.43 
 
 		 471 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4979  amidophosphoribosyltransferase  50.43 
 
 		 471 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0368  amidophosphoribosyltransferase  50.43 
 
 		 471 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1032  amidophosphoribosyltransferase  49.78 
 
 		 495 aa  460  9.999999999999999e-129  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0276  amidophosphoribosyltransferase  50.65 
 
 		 471 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0522  amidophosphoribosyltransferase  48.35 
 
 		 465 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0274  amidophosphoribosyltransferase  50.43 
 
 		 471 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5556  amidophosphoribosyltransferase  51.4 
 
 		 511 aa  457  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0341  amidophosphoribosyltransferase  50.22 
 
 		 471 aa  457  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3588  amidophosphoribosyltransferase  51.26 
 
 		 503 aa  455  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.51846 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3396  amidophosphoribosyltransferase  47.84 
 
 		 492 aa  452  1.0000000000000001e-126  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3637  amidophosphoribosyltransferase  49.06 
 
 		 499 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.811729 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0398  amidophosphoribosyltransferase  50.77 
 
 		 480 aa  452  1.0000000000000001e-126  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0878  glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase  49.02 
 
 		 503 aa  449  1e-125  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>