More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2473 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2473  formimidoylglutamase  100 
 
 		 325 aa  650    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2879  formimidoylglutamase  98.15 
 
 		 325 aa  638    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2645  formimidoylglutamase  82.1 
 
 		 325 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0232342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23170  formimidoylglutamase  54.52 
 
 		 311 aa  315  7e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000566858 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1954  formimidoylglutamase  54.46 
 
 		 311 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0479136  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5045  formimidoylglutamase  55.27 
 
 		 329 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0706  formimidoylglutamase  47.45 
 
 		 344 aa  302  7.000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.979825  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0824  formimidoylglutamase  49.85 
 
 		 336 aa  292  5e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000103972  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02074  formimidoylglutamase  45.92 
 
 		 345 aa  290  3e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4072  formimidoylglutamase  51.48 
 
 		 311 aa  288  7e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003721  formiminoglutamase  48.59 
 
 		 336 aa  286  4e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1591  formimidoylglutamase  50.32 
 
 		 316 aa  280  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854602  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2795  formimidoylglutamase  49.51 
 
 		 315 aa  272  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2388  formimidoylglutamase  49.19 
 
 		 315 aa  271  8.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.770652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2046  formimidoylglutamase  47.81 
 
 		 322 aa  269  4e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.55166  normal  0.477762 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1031  formimidoylglutamase  45.79 
 
 		 348 aa  262  6.999999999999999e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.454798  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0764  formimidoylglutamase  41.64 
 
 		 319 aa  259  4e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0746  formimidoylglutamase  41.64 
 
 		 319 aa  258  1e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4413  formimidoylglutamase  47.65 
 
 		 320 aa  256  5e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.624184 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0849  formimidoylglutamase  41.05 
 
 		 358 aa  252  6e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0322036 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1018  formiminoglutamase  42.38 
 
 		 326 aa  240  2e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02330  formimidoylglutamase  46.77 
 
 		 348 aa  236  3e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03130  probable arginase family protein  41.67 
 
 		 334 aa  232  8.000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1933  formimidoylglutamase  39.7 
 
 		 363 aa  229  3e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.541509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30730  formiminoglutamase  48.39 
 
 		 329 aa  229  4e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2010  formiminoglutamase  41.67 
 
 		 333 aa  227  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.547952  normal  0.0717595 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0599  formimidoylglutamase  47.15 
 
 		 325 aa  226  4e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00699527 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1261  formimidoylglutamase  44.01 
 
 		 312 aa  222  7e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0379  formimidoylglutamase  46.98 
 
 		 323 aa  222  7e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0852  formimidoylglutamase  42.49 
 
 		 313 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0883  formimidoylglutamase  42.17 
 
 		 313 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1279  formiminoglutamase  36.1 
 
 		 325 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0915  formimidoylglutamase  42.17 
 
 		 313 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0824  formimidoylglutamase  42.17 
 
 		 313 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0938  formimidoylglutamase  41.85 
 
 		 313 aa  211  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.62567 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03170  formiminoglutamase  42.09 
 
 		 317 aa  199  7e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2157  formiminoglutamase  42.11 
 
 		 322 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2359  formimidoylglutamase  35.96 
 
 		 311 aa  195  8.000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2402  formimidoylglutamase  35.96 
 
 		 311 aa  195  8.000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1919  formimidoylglutamase  36.59 
 
 		 311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3735  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  33.69 
 
 		 316 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498261  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4346  Agmatinase  28.21 
 
 		 478 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.534674 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1596  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  32.11 
 
 		 316 aa  97.4  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3402  formimidoylglutamase  28.41 
 
 		 323 aa  97.1  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.786826  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3682  formimidoylglutamase  27.34 
 
 		 323 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0214303  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3677  formimidoylglutamase  28.73 
 
 		 323 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.707468  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3439  formimidoylglutamase  28.36 
 
 		 323 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3709  formimidoylglutamase  28.36 
 
 		 323 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.545495  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3659  formimidoylglutamase  28.36 
 
 		 323 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1481  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  30.18 
 
 		 267 aa  94  3e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.354652 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3351  formimidoylglutamase  28.36 
 
 		 323 aa  94  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3757  formimidoylglutamase  27.99 
 
 		 323 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3336  formimidoylglutamase  28.36 
 
 		 323 aa  91.3  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.301376  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1559  formimidoylglutamase  27.99 
 
 		 323 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459006  normal  0.0875298 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2470  arginase  30.54 
 
 		 322 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.014347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2309  formimidoylglutamase  28.52 
 
 		 322 aa  87.8  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4042  formiminoglutamase  27.64 
 
 		 304 aa  87  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.954236  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5671  putative agmatinase  28.03 
 
 		 369 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1806  agmatinase  28.9 
 
 		 365 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.885321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2764  agmatinase  28.01 
 
 		 345 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.255476  normal  0.814002 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5218  agmatinase  27.72 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5050  agmatinase (agmatine ureohydrolase)  27.72 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5461  putative agmatinase  27.72 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5617  agmatinase  27.72 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5163  putative agmatinase  28.95 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1825  agmatinase  28.9 
 
 		 365 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.028899  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2734  agmatinase  28.01 
 
 		 345 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1872  agmatinase  28.9 
 
 		 365 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2778  agmatinase  28.01 
 
 		 345 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3835  formiminoglutamase  31.19 
 
 		 328 aa  83.2  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0149  arginase  26.4 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2732  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  29.43 
 
 		 311 aa  82.8  0.000000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.167247  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5066  agmatinase (agmatine ureohydrolase)  27.72 
 
 		 290 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0153  arginase  25.32 
 
 		 300 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000739593  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1543  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  27.21 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0983244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3303  putative agmatinase  27.48 
 
 		 340 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.345323  normal  0.151363 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3883  putative agmatinase  27.82 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0285  agmatinase  28.9 
 
 		 356 aa  79.7  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3224  agmatinase  30.03 
 
 		 333 aa  79.7  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.583379  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5498  agmatinase, putative  27.37 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5491  putative agmatinase  27.37 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5460  putative agmatinase  27.37 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5547  putative agmatinase  27.37 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2266  arginase  28.85 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0352  arginase  28.99 
 
 		 331 aa  76.6  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.256308 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4832  agmatinase  27.59 
 
 		 378 aa  75.9  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3460  agmatinase  25.94 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0848  agmatinase  26.69 
 
 		 340 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.384974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3024  putative agmatinase  28.99 
 
 		 354 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197883  normal  0.651701 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2557  arginase  26.47 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.579641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0232  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  25.93 
 
 		 328 aa  73.9  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4106  formiminoglutamase  29.18 
 
 		 332 aa  72.8  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3350  agmatinase  25.93 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00473387  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1073  arginase  29.24 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0745  agmatinase  30.45 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00217133  hitchhiker  0.00435081 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0694  agmatinase  25 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.464925  normal  0.230846 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0515  arginase  28.04 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.299985 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0509  putative agmatinase  30.22 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5725  agmatinase  25.26 
 
 		 346 aa  71.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.672273 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0147  arginase  24.34 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>