More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4587 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0170  hypothetical protein  92.35 
 
 
588 aa  1051    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2782  ABC-1 domain protein  57.12 
 
 
613 aa  670    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95149  normal  0.892849 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4587  hypothetical protein  100 
 
 
610 aa  1230    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0690861  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4721  hypothetical protein  44.84 
 
 
562 aa  459  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2052  ABC-1 domain protein  38.26 
 
 
570 aa  330  5.0000000000000004e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000299462 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4701  ABC-1 domain protein  35.98 
 
 
576 aa  324  3e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1468  hypothetical protein  34.16 
 
 
562 aa  294  3e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.954776  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3381  hypothetical protein  32.63 
 
 
578 aa  277  5e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0626  ABC-1 domain protein  33.26 
 
 
585 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0222  ABC-1 domain protein  31.36 
 
 
571 aa  273  8.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.164391  normal  0.703829 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3964  ABC-1 domain-containing protein  32.35 
 
 
561 aa  272  2e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3425  hypothetical protein  31.57 
 
 
563 aa  268  2e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416231  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0155  ABC-1 domain protein  30.62 
 
 
584 aa  267  5e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00185412  normal  0.0113585 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0159  ABC-1 domain protein  32.6 
 
 
561 aa  266  8e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1003  hypothetical protein  33.89 
 
 
580 aa  265  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0868  hypothetical protein  33.47 
 
 
582 aa  263  4.999999999999999e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000924249  normal  0.0678292 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  37.53 
 
 
556 aa  261  4e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1965  ABC-1 domain protein  32.13 
 
 
564 aa  248  3e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal  0.247852 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1606  ABC-1 domain protein  33.02 
 
 
566 aa  246  9.999999999999999e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2382  ABC-1 domain protein  32.05 
 
 
557 aa  243  7e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.423464  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2690  ABC-1 domain protein  34.57 
 
 
582 aa  242  1e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.066858  normal  0.0662715 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02271  putative kinase  32.08 
 
 
555 aa  241  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.61 
 
 
554 aa  240  5e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1576  putative kinase  31.03 
 
 
559 aa  239  8e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02851  putative kinase  30.9 
 
 
541 aa  239  8e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  32.86 
 
 
558 aa  239  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  33.47 
 
 
558 aa  238  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2477  kinase  34.08 
 
 
550 aa  238  3e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.312771  normal  0.0435019 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2681  hypothetical protein  30.27 
 
 
547 aa  237  4e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.259023 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02281  putative kinase  32.72 
 
 
560 aa  237  5.0000000000000005e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1388  hypothetical protein  29.71 
 
 
561 aa  236  6e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000298772  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2205  hypothetical protein  30.69 
 
 
552 aa  236  7e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0211  putative kinase  31.62 
 
 
555 aa  236  8e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1088  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  32.28 
 
 
561 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0289446  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27711  putative kinase  33.95 
 
 
559 aa  235  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2256  ABC-1 domain protein  30.4 
 
 
560 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398282 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  28.66 
 
 
559 aa  234  3e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1043  hypothetical protein  29.15 
 
 
559 aa  234  4.0000000000000004e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.135473  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4898  ABC1 family protein  29.63 
 
 
558 aa  234  5e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2342  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  32.28 
 
 
563 aa  233  7.000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000602733  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2162  kinase  34.06 
 
 
559 aa  232  1e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02291  putative kinase  31.61 
 
 
555 aa  232  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  29.72 
 
 
559 aa  231  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3377  ABC-1 domain protein  34.32 
 
 
557 aa  231  3e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118171 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  29.35 
 
 
558 aa  231  4e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02381  putative kinase  30.1 
 
 
555 aa  230  7e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.802769  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1817  hypothetical protein  31.25 
 
 
571 aa  229  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.457399  normal  0.0626146 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0760  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.34 
 
 
561 aa  228  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0708  hypothetical protein  32.94 
 
 
583 aa  226  8e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0825  ABC-1 domain protein  28.87 
 
 
558 aa  226  8e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  32.19 
 
 
557 aa  226  9e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1310  ABC-1 domain protein  30.59 
 
 
562 aa  226  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1338  ABC-1 domain protein  30.59 
 
 
562 aa  226  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000328718 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3884  ABC-1 domain protein  29.75 
 
 
556 aa  225  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2950  ABC-1 domain protein  28.46 
 
 
549 aa  225  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3267  ABC-1 domain protein  31.31 
 
 
567 aa  225  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1760  ABC-1 domain-containing protein  28.96 
 
 
547 aa  224  3e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.794373  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3101  ABC-1 domain protein  33 
 
 
564 aa  223  6e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0342  ABC1 family protein  29.86 
 
 
551 aa  223  7e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2767  ABC-1 domain protein  29.15 
 
 
549 aa  223  9e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3335  ABC-1 domain protein  29.15 
 
 
549 aa  223  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0521538  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  27.67 
 
 
558 aa  222  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2586  ABC-1 domain protein  30.83 
 
 
562 aa  221  3e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2664  2-octaprenylphenol hydroxylase  28.04 
 
 
573 aa  221  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.948881  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1211  ABC-1 domain protein  31.93 
 
 
545 aa  220  5e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1941  ABC-1 domain protein  29.13 
 
 
549 aa  219  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  30.99 
 
 
565 aa  219  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5305  ABC-1 domain protein  30.99 
 
 
565 aa  219  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0918  serine/threonine protein kinase  27.43 
 
 
526 aa  218  4e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12230  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.21 
 
 
559 aa  217  4e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2582  ABC-1 domain protein  31.78 
 
 
583 aa  217  5e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0240  ABC-1 domain protein  31.56 
 
 
544 aa  217  5.9999999999999996e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2905  ABC-1 domain-containing protein  31.94 
 
 
574 aa  216  7e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4049  hypothetical protein  29.6 
 
 
556 aa  216  9.999999999999999e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.240057  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0578  hypothetical protein  33.62 
 
 
560 aa  216  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0902  ABC-1 domain protein  29.42 
 
 
560 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  27.64 
 
 
557 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3359  ABC-1 domain protein  29.42 
 
 
560 aa  214  4.9999999999999996e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.779537 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1110  ABC-1 domain protein  30.85 
 
 
599 aa  214  5.999999999999999e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2512  hypothetical protein  30.66 
 
 
569 aa  213  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.857337 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3494  2-octaprenylphenol hydroxylase  29.59 
 
 
530 aa  213  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  28.09 
 
 
547 aa  212  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0305  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  30.1 
 
 
560 aa  211  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  28.35 
 
 
555 aa  211  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0481  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  30.1 
 
 
560 aa  211  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0128618  hitchhiker  0.0000163657 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1709  hypothetical protein  28.88 
 
 
514 aa  209  9e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0661252 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4248  ABC-1 domain protein  31.17 
 
 
553 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00077859  hitchhiker  0.0000000999881 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0318  hypothetical protein  29.2 
 
 
592 aa  209  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0340511  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0647  hypothetical protein  29.22 
 
 
565 aa  208  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000186884  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1207  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  30.85 
 
 
553 aa  208  2e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.842555  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1778  hypothetical protein  31.56 
 
 
619 aa  207  4e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2852  hypothetical protein  26.95 
 
 
537 aa  207  5e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1497  ABC-1 domain protein  31.01 
 
 
689 aa  206  7e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000360105  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3680  ABC-1 domain protein  30.32 
 
 
670 aa  206  8e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39458  predicted protein  29.6 
 
 
660 aa  206  8e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.297537 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1474  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  29.54 
 
 
561 aa  206  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.604813 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0631  hypothetical protein  32.48 
 
 
558 aa  206  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206757 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00151  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  29.27 
 
 
558 aa  205  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0390  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.66 
 
 
559 aa  205  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2537  hypothetical protein  26.74 
 
 
537 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>