30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3230 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3230  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  345  2e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3718  hypothetical protein  85.8 
 
 		 169 aa  304  4.0000000000000004e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431162 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2942  hypothetical protein  62.94 
 
 		 169 aa  191  4e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0497  hypothetical protein  57.25 
 
 		 164 aa  189  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000155339  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0681  hypothetical protein  40.68 
 
 		 125 aa  94.7  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1533  hypothetical protein  37.24 
 
 		 165 aa  93.2  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.475102  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11760  hypothetical protein  32.31 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.032321 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2655  hypothetical protein  36.21 
 
 		 170 aa  78.2  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0831745  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0626  hypothetical protein  28.57 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1908  hypothetical protein  34.75 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000174036 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08990  hypothetical protein  33.7 
 
 		 142 aa  67.4  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.910252  normal  0.577713 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3473  response regulator receiver domain-containing protein  42.31 
 
 		 823 aa  55.1  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2364  response regulator receiver protein  40.91 
 
 		 806 aa  51.2  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0574  hypothetical protein  33.33 
 
 		 190 aa  47.8  0.00008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0508  hypothetical protein  39.29 
 
 		 190 aa  47  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0461  hypothetical protein  39.66 
 
 		 356 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4862  methionyl-tRNA synthetase  30.67 
 
 		 544 aa  47  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0329  hypothetical protein  39.29 
 
 		 190 aa  47  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.135446  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0067  methionyl-tRNA synthetase  30.67 
 
 		 544 aa  47  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1411  hypothetical protein  37.5 
 
 		 190 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0315  hypothetical protein  43.14 
 
 		 352 aa  45.4  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.392755 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0646  hypothetical protein  34.88 
 
 		 110 aa  44.7  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5177  methionyl-tRNA synthetase  29.33 
 
 		 544 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5183  methionyl-tRNA synthetase  29.33 
 
 		 544 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5192  methionyl-tRNA synthetase  29.33 
 
 		 544 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0542  hypothetical protein  35.59 
 
 		 374 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884235 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1756  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  34.69 
 
 		 388 aa  42  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281872  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0982  putative transcriptional regulator, CopG family  38 
 
 		 246 aa  41.6  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.01357  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5147  methionyl-tRNA synthetase  28 
 
 		 544 aa  40.8  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4747  methionyl-tRNA synthetase  28 
 
 		 544 aa  40.8  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>