More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2679 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3750  NAD synthetase  58.74 
 
 		 699 aa  775    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0534527 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4405  NAD synthetase  60.56 
 
 		 690 aa  821    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.863566  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2610  NAD synthetase  62.23 
 
 		 682 aa  885    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1782  NAD+ synthetase  58.9 
 
 		 686 aa  789    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0217619 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1200  NAD synthetase  50.15 
 
 		 642 aa  647    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2095  NAD synthetase  60.09 
 
 		 714 aa  865    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2642  NAD synthetase  59.68 
 
 		 680 aa  827    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2595  NAD synthetase  59.7 
 
 		 687 aa  794    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.649167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3633  NAD+ synthetase  69.46 
 
 		 704 aa  994    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400497  hitchhiker  0.00213692 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3271  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  58.53 
 
 		 682 aa  753    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0919  NAD synthetase  58.35 
 
 		 802 aa  780    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2204  NAD synthetase  89.05 
 
 		 692 aa  1269    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0453723  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2533  NAD synthetase  68.04 
 
 		 691 aa  941    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12465  NAD synthetase  58.82 
 
 		 738 aa  808    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000230879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5214  NAD+ synthetase  58.05 
 
 		 680 aa  804    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0536681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1103  NAD synthetase  59.97 
 
 		 684 aa  809    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.635077 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0979  NAD synthetase  58.53 
 
 		 678 aa  790    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.989674  normal  0.179553 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3548  NAD synthetase  58.68 
 
 		 680 aa  805    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0680  NAD synthetase  62.24 
 
 		 716 aa  883    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.576503 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3909  NAD synthase  59.08 
 
 		 678 aa  800    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2169  NAD synthetase  60.67 
 
 		 685 aa  842    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0634324  hitchhiker  0.00000227772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3543  NAD synthetase  58.68 
 
 		 680 aa  805    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4206  NAD synthetase  63.49 
 
 		 681 aa  850    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0483  NAD+ synthetase  60 
 
 		 679 aa  820    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4906  NAD synthetase  60.03 
 
 		 679 aa  789    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0664942  hitchhiker  0.00795147 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2679  NAD synthetase  100 
 
 		 686 aa  1403    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4517  NAD synthetase  60 
 
 		 690 aa  816    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4035  NAD synthetase  60.44 
 
 		 690 aa  815    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650104 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2164  NAD synthetase  60.82 
 
 		 689 aa  867    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4914  NAD synthetase  60.29 
 
 		 683 aa  813    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2044  NAD synthetase  57.81 
 
 		 681 aa  783    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2890  NAD synthetase  60.91 
 
 		 679 aa  823    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3616  NAD synthetase  58.68 
 
 		 680 aa  805    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.4812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3940  NAD synthetase  59.38 
 
 		 680 aa  812    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0325  NAD synthetase  48.21 
 
 		 645 aa  632  1e-179  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0404544  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2216  NAD synthetase  45.78 
 
 		 652 aa  566  1e-160  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808702  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3426  NAD+ synthetase  44.93 
 
 		 647 aa  566  1e-160  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0531  NAD synthetase  44.86 
 
 		 647 aa  562  1.0000000000000001e-159  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1130  NAD synthetase  44.7 
 
 		 635 aa  546  1e-154  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1314  NAD synthetase  44.7 
 
 		 635 aa  544  1e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0182  NAD+ synthetase  43.8 
 
 		 676 aa  512  1e-144  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0620  NAD+ synthetase  44.46 
 
 		 644 aa  497  1e-139  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.232331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28360  NAD synthase  59.3 
 
 		 846 aa  442  9.999999999999999e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.455485  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1400  NAD synthetase  33.19 
 
 		 650 aa  311  4e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0507  NAD+ synthetase  31.74 
 
 		 600 aa  283  8.000000000000001e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3480  NAD+ synthetase  30.53 
 
 		 587 aa  198  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0342868  normal  0.0247199 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  26.07 
 
 		 573 aa  179  2e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  27.49 
 
 		 576 aa  173  9e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  27.67 
 
 		 576 aa  172  2e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  26.32 
 
 		 583 aa  169  2e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2763  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  29.74 
 
 		 577 aa  167  5.9999999999999996e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  28.57 
 
 		 554 aa  164  4.0000000000000004e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  25.57 
 
 		 574 aa  163  8.000000000000001e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  27.98 
 
 		 566 aa  162  2e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1122  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  27.32 
 
 		 566 aa  160  8e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.049761  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  26.64 
 
 		 566 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1290  NAD synthetase  28.38 
 
 		 538 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.279167 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1869  NAD+ synthetase  26.66 
 
 		 575 aa  149  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0461361  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  26.76 
 
 		 542 aa  145  2e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  26.58 
 
 		 542 aa  142  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0969  NAD(+) synthetase  28.04 
 
 		 539 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3297  NAD+ synthetase  27.38 
 
 		 599 aa  139  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  27.51 
 
 		 556 aa  139  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1882  NAD+ synthetase  27.07 
 
 		 552 aa  137  5e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2832  NAD+ synthetase  25.64 
 
 		 686 aa  137  8e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1253  NAD+ synthetase  27.01 
 
 		 584 aa  137  9e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.0942675 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0150  NAD+ synthetase  26.35 
 
 		 543 aa  135  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2296  NAD+ synthetase  25.53 
 
 		 543 aa  134  6.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0311  NAD+ synthetase  28.62 
 
 		 567 aa  134  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  26.43 
 
 		 564 aa  133  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0811  NAD+ synthetase  27.02 
 
 		 546 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0426  NAD+ synthetase  27.02 
 
 		 548 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.277898  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1261  NAD synthetase  26.15 
 
 		 540 aa  131  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143958  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1154  NAD synthetase  26.15 
 
 		 540 aa  131  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3630  NAD synthetase  26.15 
 
 		 540 aa  130  7.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3650  NAD synthetase  25.96 
 
 		 540 aa  130  7.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1011  NAD synthetase  27.02 
 
 		 545 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0196449  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2309  NAD+ synthetase  24.71 
 
 		 562 aa  130  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0925  NAD+ synthetase  27.39 
 
 		 590 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3593  NAD+ synthetase  25.68 
 
 		 577 aa  129  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2601  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.58 
 
 		 597 aa  128  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1524  NAD+ synthetase  24.85 
 
 		 559 aa  128  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.14105 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3108  NAD+ synthetase  26.18 
 
 		 591 aa  127  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105483  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1409  NAD synthetase  22.33 
 
 		 561 aa  126  1e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1699  NAD+ synthetase  25.17 
 
 		 561 aa  126  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2553  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  25.92 
 
 		 540 aa  125  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0396005 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0640  NAD+ synthetase  25.38 
 
 		 700 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0635505 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1990  NAD+ synthetase  26.34 
 
 		 561 aa  125  3e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3401  NAD+ synthetase  25.49 
 
 		 611 aa  124  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3340  NAD+ synthetase  27.94 
 
 		 598 aa  125  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0887  NAD synthetase  26.73 
 
 		 545 aa  124  5e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2549  NAD+ synthetase  26.9 
 
 		 541 aa  124  6e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402405  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0590  NAD+ synthetase  28.12 
 
 		 549 aa  123  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0428  glutamine-dependent NAD+ synthetase  28.12 
 
 		 549 aa  123  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1886  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  27.7 
 
 		 535 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0296  NAD+ synthetase  26 
 
 		 567 aa  122  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.50614  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0553  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  28.88 
 
 		 577 aa  121  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.795829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0270  putative NH3-dependent (glutamine-hydrolyzing) NAD(+) synthetase  25.84 
 
 		 567 aa  121  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0983  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  27.74 
 
 		 577 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.29742  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2535  NAD+ synthetase  25.79 
 
 		 538 aa  121  3.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>