More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5599 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1494  Catalase  73.18 
 
 		 485 aa  746    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0618429  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1147  catalase  68.42 
 
 		 479 aa  684    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.11065  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0481  catalase  64.27 
 
 		 479 aa  641    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000437674 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0903  catalase  64.15 
 
 		 504 aa  652    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2441  catalase  76.26 
 
 		 481 aa  787    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.431026  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0656  catalase  71.64 
 
 		 506 aa  709    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4417  Catalase  69.25 
 
 		 490 aa  708    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0279064  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1395  catalase  64.78 
 
 		 505 aa  659    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000176487  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001311  catalase  74.95 
 
 		 479 aa  768    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21110  catalase  75.63 
 
 		 487 aa  760    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218837 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1574  hypothetical protein  67.52 
 
 		 501 aa  677    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0310454 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4268  catalase  74.74 
 
 		 483 aa  756    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0338278  normal  0.901094 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2662  catalase  74.62 
 
 		 486 aa  753    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1759  Catalase  72.92 
 
 		 483 aa  741    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.191846  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1422  catalase  64.78 
 
 		 505 aa  659    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000148509  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0864  catalase  73.32 
 
 		 482 aa  741    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3278  catalase  69.83 
 
 		 478 aa  711    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4001  catalase  78.99 
 
 		 487 aa  811    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2262  catalase-like  77.41 
 
 		 477 aa  788    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1320  catalase  71.94 
 
 		 479 aa  726    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0510  catalase  64.06 
 
 		 479 aa  637    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1323  catalase  71.16 
 
 		 478 aa  726    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2521  catalase  66.11 
 
 		 484 aa  672    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0794366  normal  0.723936 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0518  Catalase  68.83 
 
 		 483 aa  713    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.309279  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0032  catalase  63.16 
 
 		 485 aa  647    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00175553  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2776  catalase  71.94 
 
 		 479 aa  727    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1165  Catalase  69.1 
 
 		 547 aa  710    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3986  catalase  63.94 
 
 		 484 aa  661    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2706  Catalase  72.8 
 
 		 499 aa  745    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3881  catalase  71.25 
 
 		 480 aa  729    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000327701  hitchhiker  0.000000338063 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1999  catalase  69.75 
 
 		 514 aa  697    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.209766  normal  0.601662 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5599  catalase  100 
 
 		 481 aa  1006    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.555062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5439  Catalase  75.16 
 
 		 485 aa  753    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0128  Catalase  65.68 
 
 		 517 aa  651    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0269  catalase  71.37 
 
 		 504 aa  721    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.146052  normal  0.35045 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05192  catalase  74.95 
 
 		 478 aa  768    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2855  catalase  71.94 
 
 		 479 aa  728    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4722  catalase  63.64 
 
 		 479 aa  635    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.356848 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09150  catalase  72.9 
 
 		 482 aa  737    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.789625 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0514  catalase  64.48 
 
 		 479 aa  641    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0447892 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1958  catalase  73.12 
 
 		 483 aa  743    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0712  Catalase  63.64 
 
 		 484 aa  654    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1721  catalase  76.37 
 
 		 487 aa  769    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1932  catalase  72.78 
 
 		 488 aa  748    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1242  Catalase  74.42 
 
 		 480 aa  761    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122794 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1801  Catalase  69.89 
 
 		 496 aa  712    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3018  catalase  74.58 
 
 		 485 aa  760    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0215  catalase  75.48 
 
 		 483 aa  774    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4522  catalase  62.74 
 
 		 481 aa  625  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5053  catalase-like  62.53 
 
 		 484 aa  626  1e-178  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.272262  normal  0.0793097 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0546  Catalase  59.91 
 
 		 574 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0830  catalase  60.13 
 
 		 480 aa  603  1.0000000000000001e-171  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2465  Catalase  60.59 
 
 		 485 aa  601  1e-170  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.864013 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2489  catalase  60.92 
 
 		 484 aa  593  1e-168  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.350666  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5844  Catalase  58.75 
 
 		 493 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453783  normal  0.956183 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1421  catalase  58.11 
 
 		 488 aa  570  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.898508  normal  0.0406547 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2779  catalase  58.11 
 
 		 488 aa  570  1e-161  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.432347  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0355  catalase  58.16 
 
 		 499 aa  567  1e-160  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.692778  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0322  catalase  58.16 
 
 		 499 aa  567  1e-160  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2779  Catalase  57.56 
 
 		 498 aa  556  1e-157  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1057  catalase  58.56 
 
 		 480 aa  556  1e-157  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.852537  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2321  catalase  57.23 
 
 		 501 aa  553  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3054  catalase  56.49 
 
 		 499 aa  552  1e-156  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1387  catalase  57.65 
 
 		 474 aa  550  1e-155  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000679986  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1576  catalase  57.44 
 
 		 474 aa  549  1e-155  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.278462  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0265  catalase  57.44 
 
 		 474 aa  549  1e-155  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0273  catalase  57.11 
 
 		 474 aa  546  1e-154  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0383  catalase  56.07 
 
 		 494 aa  539  9.999999999999999e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0365  Catalase  53.43 
 
 		 490 aa  533  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.357048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3940  catalase  54 
 
 		 493 aa  534  1e-150  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.109711  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0333  Catalase  52.81 
 
 		 490 aa  529  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.90897  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0289  catalase  53.22 
 
 		 490 aa  530  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.745578 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0638  catalase  54.89 
 
 		 487 aa  530  1e-149  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0778  Catalase  54.73 
 
 		 507 aa  525  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3392  Catalase  52.99 
 
 		 491 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0894  catalase  53.21 
 
 		 491 aa  522  1e-147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3029  catalase  53.2 
 
 		 486 aa  524  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.590786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0945  catalase  53.2 
 
 		 486 aa  523  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0885996  normal  0.400146 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0563  catalase  53.53 
 
 		 486 aa  523  1e-147  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2941  catalase  53.7 
 
 		 488 aa  524  1e-147  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0358189 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1070  catalase  52.99 
 
 		 486 aa  520  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3468  catalase  53.21 
 
 		 491 aa  521  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.482946  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3591  catalase  52.8 
 
 		 491 aa  521  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0908  catalase domain-containing protein  52.78 
 
 		 486 aa  521  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.161902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5463  Catalase  53.16 
 
 		 481 aa  518  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3190  catalase  52.58 
 
 		 486 aa  514  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0631825  normal  0.81248 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0523  catalase  51.99 
 
 		 504 aa  505  9.999999999999999e-143  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.903425  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0814  catalase  51.79 
 
 		 505 aa  500  1e-140  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0481  catalase  50.21 
 
 		 498 aa  500  1e-140  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00522  catalase  50.52 
 
 		 491 aa  488  1e-137  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1649  catalase  52.15 
 
 		 555 aa  484  1e-135  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0672008  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1622  Catalase  52.95 
 
 		 500 aa  483  1e-135  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.468937  normal  0.655187 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20430  catalase  53.11 
 
 		 499 aa  479  1e-134  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.678559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0342  Catalase  54.85 
 
 		 556 aa  481  1e-134  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3238  Catalase  49.19 
 
 		 510 aa  476  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.067006 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2782  Catalase  51.35 
 
 		 494 aa  476  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0203481 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2094  catalase  50.64 
 
 		 482 aa  474  1e-132  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.615987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1236  Catalase  50.31 
 
 		 483 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0619868  normal  0.69126 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3078  catalase  50.41 
 
 		 499 aa  470  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3637  Catalase  51.13 
 
 		 493 aa  468  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155654  decreased coverage  0.00459164 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>