37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4637 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4637  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  177  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0945048  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04773  hypothetical protein  87.64 
 
 		 114 aa  156  7e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05664  hypothetical protein  87.64 
 
 		 89 aa  155  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4562  thiamineS protein  78.65 
 
 		 89 aa  146  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5087  thiamineS protein  77.53 
 
 		 89 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3490  thiamineS protein  74.16 
 
 		 89 aa  137  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.374121 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0464  hypothetical protein  68.54 
 
 		 89 aa  135  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.368914 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5115  hypothetical protein  68.54 
 
 		 89 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3203  hypothetical protein  68.54 
 
 		 89 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5164  hypothetical protein  68.54 
 
 		 89 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3521  hypothetical protein  59.55 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0198705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2222  thiamineS  55.06 
 
 		 99 aa  98.6  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1725  thiamineS protein  53.93 
 
 		 89 aa  97.8  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1652  thiamineS protein  53.93 
 
 		 89 aa  97.1  7e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473811  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4464  thiamineS  46.07 
 
 		 89 aa  94.4  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3526  thiamineS  49.44 
 
 		 98 aa  89.4  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2441  thiamineS protein  44.94 
 
 		 89 aa  88.2  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.65649 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46760  hypothetical protein  56.18 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0263835  decreased coverage  0.000000122547 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4028  hypothetical protein  57.3 
 
 		 89 aa  84  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421738  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3392  thiamineS  44.94 
 
 		 89 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.417563  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2284  hypothetical protein  47.19 
 
 		 89 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4177  thiamineS protein  31.76 
 
 		 90 aa  50.4  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.547124  normal  0.802197 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3051  thiamineS protein  40.7 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4204  thiamineS protein  33.73 
 
 		 92 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.975285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2823  thiamineS protein  38.24 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.426705  normal  0.0485279 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1709  ThiS domain-containing protein  33.33 
 
 		 87 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1781  hypothetical protein  30.11 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8124  thiamineS protein  33.33 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6103  thiamineS protein  33.33 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.125716  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3300  thiamineS protein  33.33 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.330741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1679  thiamineS protein  23.91 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.658452  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1313  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  24.18 
 
 		 364 aa  40.8  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3865  thiamineS protein  38.46 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.262716 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3192  MoaD family protein  30 
 
 		 90 aa  40.4  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0325536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4090  thiamineS protein  32.84 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5013  thiamineS protein  26.67 
 
 		 91 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3986  thiamineS protein  33.73 
 
 		 93 aa  40  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0184315  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>