21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4554 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4554    100 
 
 		 480 bp  952    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0536907 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4274    84.18 
 
 		 1540 bp  115  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6811    83.85 
 
 		 2852 bp  113  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5143  integrase catalytic subunit  86.67 
 
 		 1539 bp  111  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.1652 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7482  integrase catalytic region  85.25 
 
 		 576 bp  99.6  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0806  putative transposase IS3/IS911  85.12 
 
 		 1647 bp  97.6  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.665244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0339  integrase catalytic subunit  85 
 
 		 1548 bp  95.6  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1742    86.73 
 
 		 1556 bp  91.7  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.812145 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2991  integrase catalytic subunit  86.14 
 
 		 1539 bp  89.7  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2672  integrase catalytic region  86.14 
 
 		 1539 bp  89.7  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.226674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3050  integrase catalytic subunit  83.74 
 
 		 1539 bp  85.7  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.985644 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1750  integrase catalytic subunit  83.76 
 
 		 1389 bp  81.8  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1714  putative transposase  84.16 
 
 		 1542 bp  73.8  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3440  integrase catalytic region  82.03 
 
 		 1602 bp  71.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.623196  normal  0.257291 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4798  integrase catalytic region  82.11 
 
 		 1539 bp  69.9  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.285753  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1110  integrase catalytic region  80.83 
 
 		 1539 bp  56  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0303    94.12 
 
 		 369 bp  52  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.260436 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1303  integrase catalytic subunit  82.5 
 
 		 1533 bp  48.1  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5652  integrase catalytic region  81.93 
 
 		 1539 bp  46.1  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5758  integrase catalytic region  81.93 
 
 		 1539 bp  46.1  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4442  integrase catalytic region  81.93 
 
 		 1539 bp  46.1  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>