34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4511 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_3974  fusaric acid resistance protein region  57.99 
 
 		 720 aa  680    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0215831 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5579  fusaric acid resistance protein region  54.78 
 
 		 688 aa  667    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.152208  hitchhiker  0.00845324 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4353  fusaric acid resistance protein region  66.81 
 
 		 665 aa  840    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4578  fusaric acid resistance protein region  55.98 
 
 		 699 aa  636    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.108784  hitchhiker  0.00000435415 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4721  fusaric acid resistance protein region  54.78 
 
 		 688 aa  667    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00201941 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4113  fusaric acid resistance protein region  56.91 
 
 		 679 aa  639    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.981168  normal  0.0322615 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3646  fusaric acid resistance protein region  54.78 
 
 		 688 aa  667    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0600324  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4511  fusaric acid resistance protein  100 
 
 		 663 aa  1309    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0314221 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2192  Fusaric acid resistance protein conserved region  47.72 
 
 		 671 aa  534  1e-150  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2120  membrane protein, putative efflux pump  46.64 
 
 		 680 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0194  fusaric acid resistance protein region  41.96 
 
 		 660 aa  394  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.140662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1055  membrane protein-like  59.94 
 
 		 773 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00532774  normal  0.601759 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0534  fusaric acid resistance domain-containing protein  37.14 
 
 		 633 aa  338  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0595  fusaric acid resistance protein region  37.14 
 
 		 633 aa  338  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0240  putative multidrug resistance protein MdtO  38.43 
 
 		 600 aa  316  7e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6555  multidrug efflux system protein MdtO  29.4 
 
 		 708 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5589  multidrug efflux system protein MdtO  24.05 
 
 		 683 aa  143  9e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4638  multidrug efflux system protein MdtO  23.92 
 
 		 683 aa  139  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3911  Fusaric acid resistance protein conserved region  33.65 
 
 		 683 aa  135  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03953  predicted multidrug efflux system component  33.65 
 
 		 683 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03913  hypothetical protein  33.65 
 
 		 683 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3946  multidrug efflux system protein MdtO  33.65 
 
 		 683 aa  134  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4326  multidrug efflux system protein MdtO  33.97 
 
 		 683 aa  134  6e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4545  multidrug efflux system protein MdtO  33.97 
 
 		 683 aa  133  9e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.15 
 
 		 697 aa  55.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1914  protein of unknown function DUF939  26.28 
 
 		 395 aa  54.7  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1796  fusaric acid resistance protein region  30.7 
 
 		 625 aa  50.4  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00451003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3001  fusaric acid resistance protein region  29.07 
 
 		 697 aa  50.4  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  30.23 
 
 		 698 aa  50.1  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2164  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.45 
 
 		 670 aa  49.7  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2166  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  19.84 
 
 		 719 aa  47  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513514  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  23.81 
 
 		 360 aa  44.7  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2694  hypothetical protein  26.25 
 
 		 721 aa  44.7  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2320  fusaric acid resistance protein region  31.49 
 
 		 713 aa  44.3  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300913  normal  0.199301 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>