151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0604 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0604  esterase/lipase-like protein  100 
 
 		 407 aa  825    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163166  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3077  esterase/lipase-like  64.8 
 
 		 271 aa  349  5e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5069  esterase/lipase-like  65.6 
 
 		 271 aa  349  6e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337118  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5791  esterase/lipase-like protein  65.6 
 
 		 271 aa  349  6e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4387  esterase/lipase-like protein  65.6 
 
 		 271 aa  348  7e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2291  hydrolase alpha/beta fold domain-containing protein  64.68 
 
 		 273 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0969  thermostable monoacylglycerol lipase  64.68 
 
 		 273 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1054  esterase/lipase  64.68 
 
 		 271 aa  345  1e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0912  hypothetical protein  58.65 
 
 		 274 aa  317  2e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0843  hypothetical protein  58.27 
 
 		 274 aa  316  5e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.338238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4661  Alpha/beta hydrolase fold  49.31 
 
 		 299 aa  256  7e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0130  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 		 313 aa  129  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513647 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1188  alpha/beta hydrolase fold  33.86 
 
 		 278 aa  127  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51206 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0346  carboxylesterase  28.51 
 
 		 265 aa  123  6e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.154149  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5564  hypothetical protein  31.73 
 
 		 296 aa  117  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0032  carboxylesterase  29.57 
 
 		 274 aa  116  7.999999999999999e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.436632  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1174  hypothetical protein  31.4 
 
 		 272 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0035  hypothetical protein  31.37 
 
 		 292 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5263  hypothetical protein  29.96 
 
 		 303 aa  104  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4327  alpha/beta hydrolase fold  33.59 
 
 		 306 aa  100  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.259256  normal  0.0593909 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5127  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 		 249 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1037  alpha/beta hydrolase fold  32.05 
 
 		 298 aa  97.1  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.824259 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1725  esterase/lipase-like protein  28.34 
 
 		 253 aa  92.8  9e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1784  esterase  27.2 
 
 		 253 aa  88.2  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000188724  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1708  putative carboxylesterase  28.68 
 
 		 257 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0775899 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2473  alpha/beta hydrolase fold  27.09 
 
 		 253 aa  86.3  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0084305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0857  carboxylesterase  28.06 
 
 		 255 aa  85.1  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00241097  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3089  putative esterase/lipase  27.13 
 
 		 265 aa  84.7  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5529  carboxylesterase  27.38 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0952  hypothetical protein  28.06 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.600635  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2227  alpha/beta hydrolase fold  26.27 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3105  alpha/beta hydrolase fold  26.4 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0635693  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2696  alpha/beta hydrolase fold  26.17 
 
 		 256 aa  79.7  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0878  alpha/beta hydrolase fold protein  28.23 
 
 		 230 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.692724 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3674  carboxylesterase  26.21 
 
 		 247 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000231487  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4922  carboxylesterase  26 
 
 		 247 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00817956  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2633  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  28.69 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3824  Esterase/lipase-like protein  23.79 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00729538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2012  putative esterase/lipase  23.02 
 
 		 247 aa  75.9  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121227  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4809  carboxylesterase  24.8 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.101541  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1336  putative carboxylesterase  39.05 
 
 		 264 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.571303 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2086  lysophospholipase L2, putative  27.13 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08180  carboxylesterase  24.4 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5233  carboxylesterase  24.8 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0438362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4819  carboxylesterase  24.8 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000134966  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5335  carboxylesterase  24.6 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00681619  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5279  carboxylesterase  24.8 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000258033  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5215  carboxylesterase  24.8 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6060  esterase/lipase  28.51 
 
 		 265 aa  73.9  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4957  carboxylesterase  24.6 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000198319  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2855  Esterase/lipase-like protein  26.62 
 
 		 306 aa  73.2  0.000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3458  Alpha/beta hydrolase fold-1  28.68 
 
 		 290 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.894454  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3278  Alpha/beta hydrolase  25.3 
 
 		 254 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1551  putative esterase/lipase  25.78 
 
 		 271 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.152669 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5244  carboxylesterase  24.39 
 
 		 247 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.239449  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5708  carboxylesterase  24.39 
 
 		 247 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00884556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2449  alpha/beta hydrolase fold  28.23 
 
 		 240 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.595551  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2956  carboxylesterase  25.61 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000116225  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1813  putative carboxylesterase  28.38 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1551  putative esterase/lipase  27.6 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.38652  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0187  carboxylesterase, putative  26.19 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1086  alpha/beta hydrolase fold protein  27.71 
 
 		 241 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3124  alpha/beta hydrolase fold  31.94 
 
 		 281 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4937  alpha/beta hydrolase fold protein  25.93 
 
 		 258 aa  68.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451506  normal  0.754378 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0547  putative carboxylesterase  32.62 
 
 		 269 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00312098 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0278  putative esterase/lipase  25.79 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000266286  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1312  alpha/beta hydrolase  26.85 
 
 		 254 aa  68.2  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0364828  normal  0.304741 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0218  alpha/beta hydrolase fold protein  29.8 
 
 		 277 aa  67  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3609  alpha/beta hydrolase fold protein  27.49 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.952569  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0449  carboxylesterase  24.39 
 
 		 246 aa  67  0.0000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3541  alpha/beta hydrolase fold  27.49 
 
 		 287 aa  67  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0205  carboxylesterase precursor  26.1 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0953521  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0804  esterase/lipase-like protein  23.98 
 
 		 246 aa  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00548514  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0820  carboxyesterase precursor-like protein  23.98 
 
 		 246 aa  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0758  esterase/lipase  27.95 
 
 		 269 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424567  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3567  alpha/beta hydrolase fold  28.2 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222843  hitchhiker  0.00484943 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2705  alpha/beta hydrolase fold protein  26.56 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.146547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0119  carboxylesterase, putative  20 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0814033  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1550  putative esterase/lipase  22.83 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00836288  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3127  alpha/beta hydrolase fold protein  23.02 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3126  carboxylesterase  24.6 
 
 		 247 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1828  acylglycerol lipase  24.42 
 
 		 272 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4397  carboxylesterase  26.25 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00786026  normal  0.386096 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2355  alpha/beta hydrolase fold  25.75 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0504703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3117  putative lipoprotein  32.56 
 
 		 389 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3116  putative lipoprotein  35.92 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3282  lipoprotein, putative  31.01 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2553  alpha/beta hydrolase fold protein  41.67 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4293  carboxylesterase  27.7 
 
 		 398 aa  56.6  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.311643  hitchhiker  0.0000139883 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1939  lysophospholipase L2, putative  25.29 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3228  Acylglycerol lipase  23.69 
 
 		 255 aa  55.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000428339  hitchhiker  0.0000308384 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14260  esterase/lipase  26.09 
 
 		 257 aa  55.1  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.15519  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1932  esterase/lipase-like protein  25.73 
 
 		 733 aa  55.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16110  esterase/lipase  26.23 
 
 		 263 aa  55.1  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0607403  normal  0.622772 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0869  esterase/lipase-like protein  22.75 
 
 		 257 aa  54.3  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2760  Esterase/lipase  28.23 
 
 		 229 aa  53.9  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01698  lipoprotein, putative  31.4 
 
 		 411 aa  53.1  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  26.42 
 
 		 303 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  26.42 
 
 		 303 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  26.42 
 
 		 303 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>