41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0490 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0490  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  297  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.399069 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0544  hypothetical protein  95.21 
 
 		 146 aa  263  5e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.465342  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0564  hypothetical protein  63.01 
 
 		 146 aa  195  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0472  hypothetical protein  62.33 
 
 		 146 aa  192  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0485  hypothetical protein  62.33 
 
 		 146 aa  192  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.507227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1821  hypothetical protein  47.24 
 
 		 144 aa  138  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1536  hypothetical protein  44.09 
 
 		 144 aa  134  4e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0290  hypothetical protein  38.85 
 
 		 148 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0031  hypothetical protein  38.85 
 
 		 148 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.154235  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0831  hypothetical protein  38.85 
 
 		 148 aa  100  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.690845  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2418  hypothetical protein  38.85 
 
 		 148 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0585  hypothetical protein  38.85 
 
 		 148 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0988  hypothetical protein  38.85 
 
 		 148 aa  100  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.909418  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5965  hypothetical protein  39.84 
 
 		 148 aa  100  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0657  hypothetical protein  38.85 
 
 		 148 aa  100  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0827  hypothetical protein  38.85 
 
 		 148 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2554  hypothetical protein  39.84 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2681  hypothetical protein  39.84 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2634  hypothetical protein  39.84 
 
 		 148 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2023  hypothetical protein  39.84 
 
 		 148 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2663  hypothetical protein  39.06 
 
 		 148 aa  97.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0664  hypothetical protein  38.28 
 
 		 148 aa  97.4  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0453  hypothetical protein  36.22 
 
 		 148 aa  93.6  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.736873  normal  0.808784 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0683  hypothetical protein  35.16 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3283  hypothetical protein  35.16 
 
 		 148 aa  90.1  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4837  hypothetical protein  33.1 
 
 		 150 aa  73.9  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.248887  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0333  hypothetical protein  30.3 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0101  hypothetical protein  30.16 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0317  hypothetical protein  31.25 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0312  hypothetical protein  31.25 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.272982  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4985  hypothetical protein  30.5 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3297  hypothetical protein  27.61 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0260  hypothetical protein  26.32 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0382  hypothetical protein  28.78 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3545  hypothetical protein  27.27 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.978032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1304  hypothetical protein  28.1 
 
 		 138 aa  57  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.360155 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0282  hypothetical protein  28.93 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.837554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1207  hypothetical protein  25.81 
 
 		 168 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3043  hypothetical protein  24.56 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3077  hypothetical protein  24.56 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.076265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0112  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  40.4  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.122457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>