281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2501 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2501  adenosine deaminase  100 
 
 
359 aa  730    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0100  adenosine deaminase  56.01 
 
 
374 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.151274 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0116  adenosine deaminase  51.67 
 
 
376 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0098  adenosine deaminase  53.39 
 
 
376 aa  361  1e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0105  adenosine deaminase  52.14 
 
 
376 aa  359  5e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0048  adenosine deaminase  50.29 
 
 
393 aa  340  2e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.331734 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1233  adenosine deaminase  45.05 
 
 
362 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1250  adenosine deaminase  45.05 
 
 
362 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.292543  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1259  adenosine deaminase  44.78 
 
 
362 aa  270  4e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4185  adenosine deaminase  44.94 
 
 
364 aa  268  8.999999999999999e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1279  Adenosine deaminase  46.2 
 
 
359 aa  267  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0684  adenosine deaminase  43.72 
 
 
362 aa  265  1e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.467946 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13344  adenosine deaminase  43.73 
 
 
365 aa  264  1e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.359069 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1592  adenosine deaminase  43.79 
 
 
362 aa  261  8.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0478787  normal  0.265955 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3954  adenosine deaminase  45.33 
 
 
365 aa  259  6e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1362  adenosine deaminase  44.48 
 
 
360 aa  258  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0789  adenosine deaminase  43.32 
 
 
367 aa  257  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1781  adenosine deaminase  42.22 
 
 
369 aa  256  4e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.234409  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05460  adenosine deaminase  42.02 
 
 
363 aa  253  3e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0815  adenosine deaminase  43.99 
 
 
364 aa  251  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.407539 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4841  adenosine deaminase  42.37 
 
 
362 aa  251  1e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.486752  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0976  adenosine deaminase  42.66 
 
 
375 aa  250  3e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3533  adenosine deaminase  44.57 
 
 
373 aa  248  1e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0451471  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5933  adenosine deaminase  41.6 
 
 
364 aa  247  3e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.2838  decreased coverage  0.0016274 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1320  adenosine deaminase  42.86 
 
 
363 aa  245  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0285514  normal  0.854573 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0686  adenosine deaminase  41.83 
 
 
366 aa  243  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.132633 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0759  adenosine deaminase  43.17 
 
 
364 aa  242  7.999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2563  adenosine deaminase  42.74 
 
 
367 aa  240  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6446  adenosine deaminase  43.55 
 
 
356 aa  237  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2829  adenosine deaminase  38.58 
 
 
332 aa  236  6e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2936  adenosine deaminase  41.69 
 
 
372 aa  235  7e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000510583  hitchhiker  0.00313698 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04960  adenosine deaminase  41.03 
 
 
403 aa  232  6e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.567283  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2515  adenosine deaminase  38.39 
 
 
332 aa  231  1e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1162  adenosine deaminase  35.95 
 
 
402 aa  222  9e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1027  adenosine deaminase  44.02 
 
 
371 aa  221  9.999999999999999e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.85452 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1121  adenosine deaminase  36.56 
 
 
331 aa  220  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3935  adenosine deaminase  37.88 
 
 
372 aa  219  5e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0943553  hitchhiker  0.00189819 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1214  adenosine deaminase  34.82 
 
 
332 aa  217  2.9999999999999998e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1002  adenosine deaminase  41.76 
 
 
367 aa  216  4e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3524  adenosine deaminase  36.89 
 
 
331 aa  216  4e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1145  adenosine deaminase  37.47 
 
 
381 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.605319  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1218  adenosine deaminase  40.78 
 
 
378 aa  209  7e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000911946 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25670  adenosine deaminase  38.55 
 
 
358 aa  208  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.362807  normal  0.209244 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1576  adenosine deaminase  37.88 
 
 
333 aa  207  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.859905  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1811  adenosine deaminase  37.88 
 
 
333 aa  206  6e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1455  adenosine deaminase  38.11 
 
 
333 aa  205  1e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2335  adenosine deaminase  37.58 
 
 
333 aa  204  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2251  adenosine deaminase  38.7 
 
 
332 aa  205  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000222957 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01592  adenosine deaminase  37.58 
 
 
333 aa  203  3e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0859025  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2019  adenosine deaminase  37.58 
 
 
333 aa  203  3e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00584459  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1698  adenosine deaminase  37.58 
 
 
333 aa  203  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1831  adenosine deaminase  37.58 
 
 
333 aa  203  3e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2007  adenosine deaminase  37.58 
 
 
333 aa  203  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00173018  normal  0.960599 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01582  hypothetical protein  37.58 
 
 
333 aa  203  3e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0779462  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2323  adenosine deaminase  38.2 
 
 
334 aa  203  3e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4395  adenosine deaminase  41.21 
 
 
358 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00582  adenosine deaminase  37.35 
 
 
334 aa  199  7e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4004  adenosine deaminase  36.53 
 
 
331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.443462 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4117  adenosine deaminase  36.53 
 
 
331 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3392  adenosine deaminase  36.28 
 
 
331 aa  197  3e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001910  adenosine deaminase  36.45 
 
 
334 aa  195  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4731  adenosine deaminase  36.53 
 
 
331 aa  194  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3912  adenosine deaminase  36.22 
 
 
331 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0265646 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1561  adenosine deaminase  36.17 
 
 
333 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000047707  normal  0.785767 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0321  adenosine deaminase  35.14 
 
 
344 aa  194  3e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.949208  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1573  adenosine deaminase  36.47 
 
 
333 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0345603  normal  0.320596 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1633  adenosine deaminase  36.17 
 
 
333 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.201891  normal  0.583171 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1711  adenosine deaminase  36.17 
 
 
333 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.804091  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4352  adenosine deaminase  35.91 
 
 
331 aa  192  8e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3177  adenosine deaminase  34.72 
 
 
346 aa  192  9e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00286404  normal  0.437767 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0791  adenosine deaminase  38.15 
 
 
336 aa  192  9e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0916684  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0046  adenosine deaminase  35.91 
 
 
331 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.105714  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3914  adenosine deaminase  35.91 
 
 
331 aa  192  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2430  adenosine deaminase  35.82 
 
 
366 aa  191  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10229  normal  0.205271 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1879  adenosine deaminase  36.17 
 
 
333 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.402444  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3627  adenosine deaminase  34.97 
 
 
331 aa  191  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0085  adenosine deaminase  37.23 
 
 
332 aa  191  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.18641 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4297  adenosine deaminase  35.6 
 
 
331 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000204337 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4494  adenosine deaminase  36.42 
 
 
331 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.290189 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1878  adenosine deaminase  35.91 
 
 
334 aa  189  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1993  adenosine deaminase  35.91 
 
 
334 aa  189  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2797  adenosine deaminase  34.02 
 
 
346 aa  189  5e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000659545  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1825  adenosine deaminase  35.91 
 
 
332 aa  189  8e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0192108 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0831  adenosine deaminase  36.01 
 
 
360 aa  188  1e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.557389  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2337  adenosine deaminase  35.47 
 
 
337 aa  187  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2867  adenosine deaminase  34.85 
 
 
353 aa  186  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0538  adenosine deaminase  33.82 
 
 
340 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000801372  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2142  adenosine deaminase  37.65 
 
 
337 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.757317  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2036  adenosine deaminase  35.17 
 
 
337 aa  182  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.96683  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1904  adenosine deaminase  36.02 
 
 
337 aa  182  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3721  adenosine deaminase  35.29 
 
 
331 aa  177  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7773  adenosine deaminase  34.71 
 
 
337 aa  172  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1969  adenosine deaminase  33.84 
 
 
329 aa  170  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000161701  unclonable  0.0000000410528 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2196  adenosine deaminase  37.08 
 
 
366 aa  169  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0041  adenosine deaminase  34.66 
 
 
332 aa  169  5e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28230  adenosine deaminase  32.79 
 
 
441 aa  169  7e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0440  adenosine deaminase  35.28 
 
 
332 aa  169  8e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0633  adenosine deaminase  33.63 
 
 
343 aa  168  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.410378  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1770  adenosine deaminase  40.28 
 
 
332 aa  168  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.39004 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1979  adenosine deaminase  30.61 
 
 
331 aa  167  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249085  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>