More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2333 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2333  6-phosphofructokinase  100 
 
 		 327 aa  659    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4275  6-phosphofructokinase  61.3 
 
 		 324 aa  407  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0615  6-phosphofructokinase  62.85 
 
 		 322 aa  405  1.0000000000000001e-112  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0161189 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3101  6-phosphofructokinase  62.77 
 
 		 322 aa  390  1e-107  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.165098 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3102  6-phosphofructokinase  57.89 
 
 		 324 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000237495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2773  6-phosphofructokinase  56.66 
 
 		 328 aa  370  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00187778  normal  0.467717 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0452  6-phosphofructokinase  57.41 
 
 		 339 aa  363  2e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.965208  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1068  6-phosphofructokinase  55.86 
 
 		 347 aa  363  2e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1624  6-phosphofructokinase  55.08 
 
 		 326 aa  361  9e-99  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.664156  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2322  6-phosphofructokinase  54.6 
 
 		 326 aa  360  2e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4591  6-phosphofructokinase  56.04 
 
 		 328 aa  355  5e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0879  6-phosphofructokinase  54.01 
 
 		 350 aa  353  1e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1461  6-phosphofructokinase  53.56 
 
 		 324 aa  348  6e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2597  6-phosphofructokinase  54.8 
 
 		 344 aa  348  7e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0115361  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05110  6-phosphofructokinase  54.1 
 
 		 328 aa  344  1e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.533639  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0033  6-phosphofructokinase  56.71 
 
 		 327 aa  342  5.999999999999999e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.421619  normal  0.208975 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2362  6-phosphofructokinase  54.13 
 
 		 326 aa  338  9e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3293  6-phosphofructokinase  52.92 
 
 		 328 aa  332  5e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2022  6-phosphofructokinase  52.01 
 
 		 340 aa  331  1e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.761403  normal  0.299205 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1637  6-phosphofructokinase  51.08 
 
 		 336 aa  324  1e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0565486  normal  0.69556 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03210  6-phosphofructokinase  51.51 
 
 		 332 aa  323  2e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506953  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0556  6-phosphofructokinase  52.34 
 
 		 329 aa  322  6e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0367843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0927  6-phosphofructokinase  51.85 
 
 		 323 aa  322  6e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.729181  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2313  6-phosphofructokinase  52.32 
 
 		 320 aa  310  2e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2592  6-phosphofructokinase  48.62 
 
 		 323 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2995  6-phosphofructokinase  51.39 
 
 		 323 aa  308  6.999999999999999e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0460308  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1258  6-phosphofructokinase  48.61 
 
 		 319 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000104743  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1055  6-phosphofructokinase  49.85 
 
 		 320 aa  303  2.0000000000000002e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0558023  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0715  6-phosphofructokinase  47.06 
 
 		 319 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1265  6-phosphofructokinase  51.53 
 
 		 322 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000177376  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3024  6-phosphofructokinase  49.23 
 
 		 328 aa  302  4.0000000000000003e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1738  6-phosphofructokinase  50.17 
 
 		 332 aa  302  6.000000000000001e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0448  6-phosphofructokinase  50.17 
 
 		 332 aa  302  6.000000000000001e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.76635  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4429  6-phosphofructokinase  51.08 
 
 		 319 aa  300  2e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0739  6-phosphofructokinase  46.75 
 
 		 319 aa  300  3e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2135  6-phosphofructokinase  52.94 
 
 		 324 aa  299  4e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1194  6-phosphofructokinase  48.61 
 
 		 321 aa  299  5e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0777  6-phosphofructokinase  50.46 
 
 		 319 aa  297  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4725  6-phosphofructokinase  50.77 
 
 		 319 aa  296  3e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4730  6-phosphofructokinase  50.77 
 
 		 319 aa  296  3e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4493  6-phosphofructokinase  50.77 
 
 		 319 aa  296  3e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4328  6-phosphofructokinase  50.77 
 
 		 319 aa  296  3e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4340  6-phosphofructokinase  50.77 
 
 		 319 aa  296  3e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4844  6-phosphofructokinase  50.77 
 
 		 319 aa  296  3e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4714  6-phosphofructokinase  50.77 
 
 		 319 aa  296  3e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.177763 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4102  6-phosphofructokinase  48.17 
 
 		 331 aa  296  4e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000646292  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1715  6-phosphofructokinase  47.06 
 
 		 320 aa  295  5e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.971383  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3283  6-phosphofructokinase  50.15 
 
 		 319 aa  295  6e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0528  6-phosphofructokinase  50.46 
 
 		 319 aa  295  8e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4709  6-phosphofructokinase  50.46 
 
 		 319 aa  295  8e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1595  6-phosphofructokinase  48.3 
 
 		 319 aa  295  1e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2686  6-phosphofructokinase  49.85 
 
 		 319 aa  294  1e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000257847  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1661  6-phosphofructokinase  48.15 
 
 		 335 aa  294  2e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0439  6-phosphofructokinase  52.01 
 
 		 320 aa  291  8e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00945264  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1262  6-phosphofructokinase  48 
 
 		 322 aa  291  1e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.845469  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0169  6-phosphofructokinase  48.61 
 
 		 323 aa  290  2e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.424049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0397  6-phosphofructokinase  45.68 
 
 		 324 aa  291  2e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1789  6-phosphofructokinase  49.08 
 
 		 322 aa  290  3e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1755  6-phosphofructokinase  49.08 
 
 		 322 aa  290  3e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.106028  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0814  6-phosphofructokinase  49.23 
 
 		 320 aa  288  8e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.951954  hitchhiker  0.00745869 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2004  6-phosphofructokinase  46.13 
 
 		 319 aa  288  8e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0376827  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0940  6-phosphofructokinase  50.65 
 
 		 340 aa  288  1e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1916  6-phosphofructokinase  44.79 
 
 		 335 aa  287  2e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1164  6-phosphofructokinase  51.82 
 
 		 339 aa  285  5.999999999999999e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00769395  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0336  6-phosphofructokinase  48.01 
 
 		 341 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0881  6-phosphofructokinase  47.99 
 
 		 319 aa  283  4.0000000000000003e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000418501  hitchhiker  0.000000000000068965 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1261  6-phosphofructokinase  47.71 
 
 		 324 aa  283  4.0000000000000003e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1868  6-phosphofructokinase  50.77 
 
 		 319 aa  282  6.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1388  6-phosphofructokinase  46.75 
 
 		 319 aa  281  9e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0089995  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2612  6-phosphofructokinase  46.2 
 
 		 327 aa  281  1e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0350  6-phosphofructokinase  47.04 
 
 		 319 aa  280  2e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0341  6-phosphofructokinase  47.34 
 
 		 319 aa  280  2e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1457  6-phosphofructokinase  51.99 
 
 		 340 aa  280  2e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0819951  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0938  6-phosphofructokinase  44.75 
 
 		 319 aa  278  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1703  6-phosphofructokinase  44.44 
 
 		 319 aa  275  6e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3032  6-phosphofructokinase  47.2 
 
 		 322 aa  274  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2068  6-phosphofructokinase  44.75 
 
 		 319 aa  272  6e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0412  6-phosphofructokinase  45.14 
 
 		 321 aa  272  6e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0649  6-phosphofructokinase  44.41 
 
 		 347 aa  265  7e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01919  6-phosphofructokinase  46.37 
 
 		 364 aa  265  8e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0246577  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2041  6-phosphofructokinase  45.85 
 
 		 318 aa  258  1e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0676  6-phosphofructokinase  43.65 
 
 		 319 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1769  6-phosphofructokinase  43.52 
 
 		 319 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0011293 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002222  6-phosphofructokinase  46.46 
 
 		 320 aa  250  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0278288  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0485  6-phosphofructokinase  45.45 
 
 		 321 aa  249  4e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2448  6-phosphofructokinase  42.9 
 
 		 319 aa  249  5e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00145  6-phosphofructokinase  46.31 
 
 		 320 aa  249  6e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2261  6-phosphofructokinase  46.92 
 
 		 331 aa  247  2e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00253507  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0591  6-phosphofructokinase  44.14 
 
 		 320 aa  246  3e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  41.21 
 
 		 340 aa  245  6e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  42.06 
 
 		 341 aa  244  9.999999999999999e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1316  6-phosphofructokinase  45.45 
 
 		 320 aa  244  9.999999999999999e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.958753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  42.06 
 
 		 344 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2519  6-phosphofructokinase  41.54 
 
 		 320 aa  243  3e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00023844  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  40.82 
 
 		 348 aa  243  3e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4807  6-phosphofructokinase  46.6 
 
 		 320 aa  243  3e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000713266 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2862  6-phosphofructokinase  41.57 
 
 		 345 aa  241  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20200  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  41.76 
 
 		 341 aa  241  1e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.732763  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4393  6-phosphofructokinase  44.78 
 
 		 320 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.481829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4460  6-phosphofructokinase  44.78 
 
 		 320 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.430831  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>