More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1596 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1596  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  100 
 
 
316 aa  638    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3735  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  36.75 
 
 
316 aa  149  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498261  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1919  formimidoylglutamase  33.22 
 
 
311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1279  formiminoglutamase  33.68 
 
 
325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2359  formimidoylglutamase  31.8 
 
 
311 aa  126  5e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2402  formimidoylglutamase  31.8 
 
 
311 aa  126  5e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0764  formimidoylglutamase  29.82 
 
 
319 aa  123  4e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23170  formimidoylglutamase  36.46 
 
 
311 aa  123  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000566858 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1954  formimidoylglutamase  34.64 
 
 
311 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0479136  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0746  formimidoylglutamase  29.47 
 
 
319 aa  122  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2157  formiminoglutamase  36.4 
 
 
322 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0232  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  31.43 
 
 
328 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0849  formimidoylglutamase  30.56 
 
 
358 aa  119  6e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0322036 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02330  formimidoylglutamase  36.07 
 
 
348 aa  117  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0938  formimidoylglutamase  33.1 
 
 
313 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.62567 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0915  formimidoylglutamase  32.74 
 
 
313 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0883  formimidoylglutamase  32.74 
 
 
313 aa  115  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0852  formimidoylglutamase  32.38 
 
 
313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0824  formimidoylglutamase  32.74 
 
 
313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1261  formimidoylglutamase  32.31 
 
 
312 aa  110  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1031  formimidoylglutamase  28.66 
 
 
348 aa  109  6e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.454798  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2795  formimidoylglutamase  34.41 
 
 
315 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2046  formimidoylglutamase  32.54 
 
 
322 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.55166  normal  0.477762 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2645  formimidoylglutamase  33.23 
 
 
325 aa  103  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0232342  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0599  formimidoylglutamase  32.98 
 
 
325 aa  103  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00699527 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2388  formimidoylglutamase  34.41 
 
 
315 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.770652  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3682  formimidoylglutamase  28.41 
 
 
323 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0214303  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3402  formimidoylglutamase  28.41 
 
 
323 aa  103  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.786826  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2010  formiminoglutamase  31.06 
 
 
333 aa  103  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.547952  normal  0.0717595 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0824  formimidoylglutamase  30.79 
 
 
336 aa  103  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000103972  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1018  formiminoglutamase  29.51 
 
 
326 aa  102  7e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5045  formimidoylglutamase  32.87 
 
 
329 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3677  formimidoylglutamase  28.03 
 
 
323 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.707468  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3439  formimidoylglutamase  28.03 
 
 
323 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3351  formimidoylglutamase  28.03 
 
 
323 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3757  formimidoylglutamase  28.03 
 
 
323 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3709  formimidoylglutamase  28.03 
 
 
323 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.545495  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3659  formimidoylglutamase  28.03 
 
 
323 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1559  formimidoylglutamase  28.41 
 
 
323 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459006  normal  0.0875298 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3336  formimidoylglutamase  28.57 
 
 
323 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.301376  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2309  formimidoylglutamase  29.17 
 
 
322 aa  99  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03130  probable arginase family protein  31.56 
 
 
334 aa  98.2  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2473  formimidoylglutamase  32.11 
 
 
325 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.730979  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0379  formimidoylglutamase  32.01 
 
 
323 aa  97.4  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2879  formimidoylglutamase  32.86 
 
 
325 aa  96.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4413  formimidoylglutamase  31.52 
 
 
320 aa  96.7  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.624184 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0706  formimidoylglutamase  29.45 
 
 
344 aa  96.7  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.979825  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30730  formiminoglutamase  35.98 
 
 
329 aa  96.3  7e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1591  formimidoylglutamase  31.56 
 
 
316 aa  95.9  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854602  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1933  formimidoylglutamase  29.9 
 
 
363 aa  92  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.541509  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5671  putative agmatinase  28.77 
 
 
369 aa  92  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  30.82 
 
 
318 aa  90.5  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02074  formimidoylglutamase  29.3 
 
 
345 aa  89.4  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003721  formiminoglutamase  29.48 
 
 
336 aa  87.8  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0848  agmatinase  28.08 
 
 
340 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.384974  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  30.1 
 
 
315 aa  87.4  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4072  formimidoylglutamase  28.47 
 
 
311 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1098  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  30.66 
 
 
305 aa  86.3  7e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.680676  normal  0.149634 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6964  agmatinase  30.8 
 
 
334 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0336544 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2732  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  30.8 
 
 
311 aa  85.5  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.167247  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  29.49 
 
 
345 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0488647 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  27.87 
 
 
330 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  27.97 
 
 
329 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  29.39 
 
 
315 aa  84.3  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1581  putative agmatinase  28.67 
 
 
288 aa  84.3  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  27.01 
 
 
316 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4872  agmatinase  27.66 
 
 
351 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.739258  normal  0.617113 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  27.97 
 
 
342 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03170  formiminoglutamase  30.66 
 
 
317 aa  83.6  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0263  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  27.34 
 
 
393 aa  83.6  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0509  putative agmatinase  27.56 
 
 
309 aa  83.2  0.000000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4042  formiminoglutamase  29.39 
 
 
304 aa  83.2  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.954236  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3988  agmatinase  28.21 
 
 
331 aa  82.8  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0861741 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1543  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  27.57 
 
 
305 aa  82.8  0.000000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0983244  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  30.34 
 
 
333 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  29.66 
 
 
326 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  29.66 
 
 
326 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  29.66 
 
 
326 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  25.44 
 
 
316 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3062  formiminoglutamase-related protein  25.9 
 
 
409 aa  82  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.511055 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4832  agmatinase  28.62 
 
 
378 aa  82  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  28.47 
 
 
319 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  27.97 
 
 
318 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3869  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  27.11 
 
 
321 aa  80.9  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.12259  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3924  agmatinase  29.97 
 
 
369 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  27.62 
 
 
318 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3835  formiminoglutamase  26.96 
 
 
328 aa  80.9  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1009  agmatinase  25.26 
 
 
318 aa  80.9  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  27.97 
 
 
354 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  27.97 
 
 
354 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0784  agmatinase, putative  28.52 
 
 
317 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  27.62 
 
 
329 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  27.62 
 
 
318 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1967  agmatinase  28.13 
 
 
321 aa  79  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0638038  normal  0.457038 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  29.41 
 
 
315 aa  79  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  27.62 
 
 
318 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  31.35 
 
 
324 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3303  putative agmatinase  28.32 
 
 
340 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.345323  normal  0.151363 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2243  agmatinase  29.43 
 
 
317 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1996  agmatinase  29.43 
 
 
317 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>