More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1152 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1152  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
370 aa  752    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1120  glycosyl transferase family protein  35.69 
 
 
324 aa  188  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0838715 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3120  family 2 glycosyl transferase  34.3 
 
 
329 aa  174  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3797  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 
329 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.5387  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3748  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 
329 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  31.79 
 
 
350 aa  139  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2481  family 2 glycosyl transferase  27.89 
 
 
340 aa  130  4.0000000000000003e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530685  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1346  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.73 
 
 
343 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.470467  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3536  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.74 
 
 
851 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000936493 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3321  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.74 
 
 
851 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3284  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.74 
 
 
851 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0268448  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3236  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.74 
 
 
851 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3582  group 2 family glycosyl transferase  28.74 
 
 
851 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2026  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.29 
 
 
853 aa  102  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.739679  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1948  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.87 
 
 
853 aa  102  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1684  glycosyl transferase family protein  28.07 
 
 
285 aa  101  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0928  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
311 aa  101  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3380  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.29 
 
 
853 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  8.74419e-17 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2383  glycosyl transferase family protein  32.58 
 
 
316 aa  99.4  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 
376 aa  99.4  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1967  glycosyl transferase family protein  43.97 
 
 
300 aa  99.4  9e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1270  general glycosylation pathway protein  34.54 
 
 
309 aa  98.2  2e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.553122  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0593  general glycosylation pathway protein  31.98 
 
 
309 aa  98.6  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.422601  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1145  general glycosylation pathway protein  32.5 
 
 
309 aa  98.2  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3238  glycosyl transferase family protein  29.83 
 
 
703 aa  97.8  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  28.18 
 
 
299 aa  97.4  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3095  glycosyl transferase family protein  35.64 
 
 
320 aa  96.7  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23695  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2715  glycosyl transferase family 2  27.56 
 
 
756 aa  94.7  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  27.51 
 
 
327 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.51 
 
 
327 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.51 
 
 
327 aa  94.4  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  27.51 
 
 
327 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0960  glycosyl transferase family 2  34.88 
 
 
338 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0106239  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0024  glycosyl transferase family 2  37.39 
 
 
358 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1120  glycosyl transferase family 2  26.94 
 
 
303 aa  92.8  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1364  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.72 
 
 
311 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.857643  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2382  glycosyl transferase family protein  33.15 
 
 
319 aa  92.8  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4597  glycosyl transferase family 2  28.26 
 
 
307 aa  92.4  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3099  glycosyl transferase family protein  33.85 
 
 
303 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.122373  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2506  b-glycosyltransferase  29.6 
 
 
309 aa  92  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3218  glycosyl transferase family protein  38.89 
 
 
246 aa  92.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1326  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.58 
 
 
313 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0340  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.77 
 
 
643 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.07 
 
 
327 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  27.07 
 
 
327 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3285  glycosyl transferase family 2  37.98 
 
 
296 aa  90.9  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.044685 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1127  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.84 
 
 
311 aa  90.9  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1107  glycosyltransferase  30.84 
 
 
311 aa  90.9  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.174738  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1219  group 2 family glycosyl transferase  30.84 
 
 
311 aa  90.9  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1288  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.84 
 
 
311 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.679665 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4968  glycosyl transferase family protein  44.44 
 
 
338 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1259  glycosyltransferase  30.6 
 
 
308 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1114  glycosyl transferase family protein  29.65 
 
 
308 aa  90.1  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0310  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.64 
 
 
643 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.37 
 
 
327 aa  89.4  9e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0305  hypothetical protein  21.88 
 
 
423 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3897  glycosyl transferase family 2  27.03 
 
 
501 aa  88.6  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2952  glycosyl transferase family 2  29.61 
 
 
377 aa  87.8  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.604226  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1101  glycosyltransferase  30.4 
 
 
313 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4082  glycosyltransferase  29 
 
 
308 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4705  glycosyl transferase family 2  28.24 
 
 
311 aa  87.4  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1837  glycosyl transferase family 2  29.72 
 
 
350 aa  87  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1122  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 
364 aa  87  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3784  glycosyl transferase family protein  39.66 
 
 
320 aa  86.7  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2388  glycosyl transferase family protein  34.48 
 
 
1007 aa  86.3  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257411  hitchhiker  0.0000141924 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5183  glycosyl transferase family 2  30.36 
 
 
315 aa  86.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3057  glycosyl transferase family protein  39.39 
 
 
318 aa  85.9  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0259  glycosyl transferase family protein  22.13 
 
 
643 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158733  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0708  glycosyltransferase  43.56 
 
 
370 aa  85.5  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0812  glycosyl transferase, group 2 family protein  43.56 
 
 
370 aa  85.5  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.23 
 
 
341 aa  85.1  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2048  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 
750 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0703  glycosyl transferase family 2  25.87 
 
 
348 aa  84.7  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.39468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1645  glycosyl transferase family 2  40 
 
 
253 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2592  glycosyltransferase domain-containing protein  27.27 
 
 
308 aa  85.1  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1567  glycosyl transferase family protein  37.9 
 
 
363 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1841  glycosyl transferase family 2  35.59 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0701  glycosyl transferase family 2  34.23 
 
 
355 aa  84.3  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000226644  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0888  b-glycosyltransferase  32.16 
 
 
333 aa  84.7  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0236559  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3922  family 2 glycosyl transferase  31.3 
 
 
334 aa  84.3  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6556  glycosyl transferase family protein  40.17 
 
 
336 aa  84.3  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.998721  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1402  glycosyl transferase family 2  35.51 
 
 
372 aa  84.3  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000124327  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0633  glycosyl transferase family 2  32.82 
 
 
333 aa  84  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.718934 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2763  glycosyl transferase family protein  38.6 
 
 
324 aa  84  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.32347  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30120  Glycosyl transferase, family 2 protein  36.69 
 
 
328 aa  83.2  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0124  glycosyl transferase family 2  26.51 
 
 
345 aa  83.2  0.000000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000042136  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0390  glycosyl transferase family protein  36.07 
 
 
341 aa  83.2  0.000000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4280  hypothetical protein  35.97 
 
 
1171 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0402  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 
269 aa  83.2  0.000000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.137221  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3756  glycosyl transferase family protein  31.7 
 
 
393 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.379294 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2888  glycosyl transferase family protein  26.48 
 
 
247 aa  83.2  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468847  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0325  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.78 
 
 
643 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0347044  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2176  glycosyl transferase family protein  38.66 
 
 
455 aa  82.8  0.000000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1433  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.16 
 
 
340 aa  82.8  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.835917  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  27.07 
 
 
336 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0710  glycosyl transferase family 2  24.92 
 
 
348 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0808  glycosyl transferase family 2  28.69 
 
 
334 aa  82  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227461  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0632  glycosyl transferase family 2  31.39 
 
 
313 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.138746  normal  0.982719 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  33.96 
 
 
326 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0317  glycosyl transferase family protein  30.71 
 
 
329 aa  82  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0399103  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>