24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0247 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0247  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 338 aa  679    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32901  predicted protein  30.14 
 
 		 249 aa  93.2  6e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0382374 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1506  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.28 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0135963  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4013  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.8 
 
 		 810 aa  50.8  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1886  putative Exodeoxyribonuclease III  26.69 
 
 		 259 aa  49.7  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0111436  normal  0.144129 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2753  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.57 
 
 		 296 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0702685  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1980  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  22.47 
 
 		 301 aa  47.8  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.244813  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1119  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.48 
 
 		 348 aa  47.8  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2783  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.01 
 
 		 313 aa  47.8  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0990816  normal  0.632411 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2847  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26 
 
 		 296 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.453576  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1247  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.69 
 
 		 437 aa  46.2  0.0008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0041  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.34 
 
 		 460 aa  46.2  0.0009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.294388  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1498  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.94 
 
 		 370 aa  45.8  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0930511  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0703  hypothetical protein  26.62 
 
 		 256 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5408  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.27 
 
 		 634 aa  45.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.521256  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0605  hypothetical protein  26.26 
 
 		 413 aa  45.1  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.662935 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1027  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.27 
 
 		 347 aa  44.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0904827  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2442  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.03 
 
 		 339 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.23952  decreased coverage  0.00360154 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  27.14 
 
 		 254 aa  44.3  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.616331  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2121  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.1 
 
 		 382 aa  44.3  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0685  hypothetical protein  25.9 
 
 		 256 aa  44.3  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0086  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.73 
 
 		 257 aa  43.9  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0080  hypothetical protein  24.73 
 
 		 302 aa  43.9  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4989  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.97 
 
 		 848 aa  43.1  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170324  normal  0.316341 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>