More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4877 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_0693  transposase  88.2 
 
 
537 aa  970    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4877  transposase IS66  100 
 
 
529 aa  1075    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386958  normal  0.659358 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4598  transposase IS66  55.39 
 
 
510 aa  550  1e-155  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.864978 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3724  hypothetical protein  55.56 
 
 
527 aa  528  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6322  transposase IS66  54.51 
 
 
505 aa  511  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4341  transposase IS66  54.51 
 
 
505 aa  511  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8372  transposase IS66  54.51 
 
 
505 aa  511  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9623  transposase  49.81 
 
 
539 aa  492  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.264971  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8249  transposase  48.54 
 
 
553 aa  481  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8231  transposase  48.54 
 
 
553 aa  481  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0659  transposase IS66  49.5 
 
 
514 aa  478  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0185  IS66 family transposase  52.17 
 
 
520 aa  473  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1223  IS66 family transposase  52.17 
 
 
520 aa  473  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4165  transposase IS66  50.52 
 
 
523 aa  474  1e-132  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.699531  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4305  hypothetical protein  49.79 
 
 
523 aa  463  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4782  transposase IS66  47.72 
 
 
530 aa  464  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3763  hypothetical protein  49.79 
 
 
523 aa  463  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.727828  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4308  hypothetical protein  49.79 
 
 
523 aa  463  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3722  hypothetical protein  49.79 
 
 
523 aa  463  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3715  IS66 Orf2 family protein  49.79 
 
 
523 aa  463  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0171  transposase IS66  49.79 
 
 
523 aa  463  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0431  transposase IS66  49.79 
 
 
523 aa  463  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0146215 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0915  transposase IS66  49.79 
 
 
523 aa  463  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.137432 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1419  transposase IS66  49.79 
 
 
523 aa  463  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3516  IS66 Orf2 family protein  49.79 
 
 
513 aa  462  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.578775  normal  0.957908 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4328  transposase IS66  44.93 
 
 
524 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4686  transposase IS66  44.93 
 
 
524 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3983  transposase IS66  48.97 
 
 
461 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2744  transposase IS66  44.73 
 
 
524 aa  403  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0556  IS66 family orf3  44.33 
 
 
523 aa  401  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.433641  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6364  transposase IS66  45.55 
 
 
524 aa  399  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39651  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0522  IS66 family element, orf3  44.13 
 
 
523 aa  397  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.615968  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0278  transposase IS66  45 
 
 
508 aa  391  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1439  TnpC protein  43.3 
 
 
523 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1450  TnpC protein  43.3 
 
 
523 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2688  TnpC protein  43.3 
 
 
523 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332618  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2735  TnpC protein  43.3 
 
 
523 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0134007  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3140  TnpC protein  43.3 
 
 
523 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6857  transposase IS66  43.07 
 
 
520 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130524  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3307  transposase IS66  66.67 
 
 
341 aa  382  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.448509 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1447  TnpC protein  43.1 
 
 
523 aa  379  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0541647  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1449  TnpC protein  43.3 
 
 
523 aa  377  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.324951  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6199  transposase IS66  44.4 
 
 
549 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.07824  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6521  transposase IS66  42.16 
 
 
531 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.707984  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4976  transposase IS66  41.73 
 
 
531 aa  371  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000420547  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0266  transposase IS66  41.39 
 
 
545 aa  367  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2470  ISAfe4, transposase orf3  41.39 
 
 
545 aa  367  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1326  transposase IS66  41.19 
 
 
545 aa  368  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0424374 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2093  transposase IS66  41.39 
 
 
545 aa  367  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1756  transposase IS66  41.39 
 
 
545 aa  367  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2726  transposase IS66  42.17 
 
 
516 aa  362  9e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0344579  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1706  ISAfe4, transposase orf3  40.35 
 
 
545 aa  361  1e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.249951  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3778  hypothetical protein  43.24 
 
 
532 aa  359  9e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.56487 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1006  IS66 family element, transposase  39.96 
 
 
512 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1001  IS66 family element, transposase  39.96 
 
 
512 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.720933  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1113  IS66 family element, transposase  39.96 
 
 
512 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4197  IS66 family element, transposase  39.96 
 
 
512 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1117  IS66 family element, transposase  39.96 
 
 
512 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1523  IS66 family element, transposase  39.96 
 
 
512 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3413  IS66 family element, transposase  39.96 
 
 
512 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1640  IS66 family element, transposase  39.96 
 
 
512 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2618  IS66 family element, transposase  39.96 
 
 
512 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2109  IS66 family element, transposase  39.96 
 
 
512 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3675  IS66 family element, transposase  39.96 
 
 
512 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2364  IS66 family element, transposase  39.96 
 
 
512 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000494012  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3096  IS66 family element, transposase  39.96 
 
 
512 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.147891  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1584  IS66 family element, transposase  39.96 
 
 
512 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0510  IS66 family element, transposase  39.96 
 
 
512 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0712  IS66 family element, transposase  39.96 
 
 
512 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0707  IS66 family element, transposase  39.96 
 
 
512 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2964  IS66 family element, transposase  39.96 
 
 
512 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2711  IS66 family element, transposase  39.96 
 
 
512 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.292603  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2947  IS66 family element, transposase  39.96 
 
 
512 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2636  IS66 family element, transposase  39.96 
 
 
512 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0147268  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3448  IS66 family element, transposase  39.96 
 
 
512 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3708  IS66 family element, transposase  39.96 
 
 
512 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00019301  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2601  IS66 family element, transposase  39.96 
 
 
512 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0017  IS66 family element, transposase  39.96 
 
 
512 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0193  IS66 family element, transposase  39.96 
 
 
512 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0228  IS66 family element, transposase  39.96 
 
 
512 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2413  IS66 family element, transposase  39.96 
 
 
512 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.624161  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4625  IS66 family element, transposase  39.96 
 
 
512 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1866  IS66 family element, transposase  39.96 
 
 
512 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.324382  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1653  IS66 family element, transposase  39.96 
 
 
512 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1644  IS66 family element, transposase  39.96 
 
 
512 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.547013  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0259  transposase  39.7 
 
 
522 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0154331 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0146  IS66 family element, transposase  39.77 
 
 
512 aa  356  6.999999999999999e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4652  IS66 family element, transposase  39.77 
 
 
512 aa  356  6.999999999999999e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4660  IS66 family element, transposase  39.77 
 
 
512 aa  355  8.999999999999999e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781469  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2123  IS66 family transposase  40.04 
 
 
537 aa  352  7e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5560  transposase IS66  41.07 
 
 
516 aa  350  4e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.438701 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2728  transposase IS66  41.26 
 
 
545 aa  348  1e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0274249  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2591  putative transposase, TnpC  40.8 
 
 
524 aa  348  1e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0711  transposase IS66  40.71 
 
 
545 aa  347  2e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.411203  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6726  transposase  39.7 
 
 
556 aa  346  5e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544647  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0898  transposase IS66  40.89 
 
 
545 aa  345  1e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.888311  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4788  transposase IS66  40.89 
 
 
545 aa  345  1e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2841  IS66 family element, transposase  39.19 
 
 
512 aa  343  5e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0678669  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2224  IS66 family element, transposase  39.19 
 
 
512 aa  343  5e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101822  hitchhiker  0.0000000000417229 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0344  IS66 family element, transposase  39.19 
 
 
512 aa  343  5e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000788528  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>