18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4632 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4632  hypothetical protein  100 
 
 
109 aa  215  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.496365  normal  0.0973138 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0026  hypothetical protein  66.06 
 
 
109 aa  145  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282024  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4361  hypothetical protein  85.32 
 
 
109 aa  144  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.014453 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1003  hypothetical protein  58.72 
 
 
135 aa  128  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3751  hypothetical protein  37.84 
 
 
115 aa  62.8  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2375  hypothetical protein  31.82 
 
 
110 aa  51.2  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000147394  hitchhiker  0.000290805 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3065  hypothetical protein  34.57 
 
 
110 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.10891  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2803  hypothetical protein  31.3 
 
 
110 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.294184  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2332  hypothetical protein  28.97 
 
 
112 aa  47.8  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.700013 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4828  hypothetical protein  32.43 
 
 
112 aa  47.4  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.187426  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2820  hypothetical protein  31.3 
 
 
110 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.804057  normal  0.0153467 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5135  RNA methyltransferase TrmH, group 3  30.28 
 
 
114 aa  46.2  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.916902  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3882  hypothetical protein  30.91 
 
 
109 aa  46.2  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2776  hypothetical protein  30.43 
 
 
119 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.238427  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0020  RNA methyltransferase TrmH, group 3  34.44 
 
 
116 aa  45.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0947613 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0620  RNA methyltransferase TrmH, group 3  37.8 
 
 
110 aa  41.6  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.1329 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3692  hypothetical protein  30.21 
 
 
154 aa  40.8  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358207  normal  0.0832405 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1022  RNA methyltransferase TrmH, group 3  26.61 
 
 
110 aa  40  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>