35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1959 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1959  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  100 
 
 
226 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0360363  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1785  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  89.82 
 
 
226 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.330524  normal  0.0882014 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0879  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  58.67 
 
 
213 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0768  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  57.08 
 
 
213 aa  278  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.057687  normal  0.668247 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5359  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.29 
 
 
226 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.720042  normal  0.770296 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5716  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.29 
 
 
226 aa  175  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.997638 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3613  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.84 
 
 
218 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4351  cyclic nucleotide-binding protein  32.17 
 
 
948 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6336  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.05 
 
 
181 aa  48.9  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.565465  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3616  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.89 
 
 
178 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2498  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.89 
 
 
178 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.212019  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4616  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.88 
 
 
188 aa  47.4  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.243719  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0124  helix-turn-helix, Fis-type  33.78 
 
 
217 aa  47.4  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.490683  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2665  hypothetical protein  28.18 
 
 
223 aa  46.2  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0352  redoxin  28.67 
 
 
214 aa  46.2  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1381  hypothetical protein  27.12 
 
 
215 aa  46.2  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2894  redoxin domain-containing protein  26.27 
 
 
215 aa  45.4  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2811  redoxin domain-containing protein  26.27 
 
 
215 aa  45.4  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0234  redoxin  29.89 
 
 
183 aa  44.3  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.436013 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0885  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.98 
 
 
223 aa  45.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5046  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.03 
 
 
151 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.14204 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0021  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36 
 
 
178 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01275  hypothetical protein  25.61 
 
 
168 aa  44.3  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2023  putative thiol-specific antioxidant protein  31.43 
 
 
178 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.384387  normal  0.424678 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1942  bacterioferritin comigratory protein-like  28.7 
 
 
150 aa  43.9  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.834483  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0306  hypothetical protein  24.29 
 
 
213 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3069  redoxin domain-containing protein  28.3 
 
 
211 aa  43.5  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1614  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.8 
 
 
188 aa  43.5  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00145031  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2933  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.62 
 
 
225 aa  42.7  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2991  redoxin domain-containing protein  26.27 
 
 
215 aa  42.7  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5164  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.64 
 
 
223 aa  42  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.279862  normal  0.954313 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0166  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.09 
 
 
167 aa  42  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.566279  normal  0.318936 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02139  thioredoxin-dependent thiol peroxidase  29.91 
 
 
154 aa  41.6  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.178426  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08280  Peroxiredoxin  32.69 
 
 
157 aa  41.6  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0954  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.71 
 
 
155 aa  41.6  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.685376 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>