21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1701 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1701  conserved hypothetical conserved membrane protein  100 
 
 		 367 aa  700    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1503  conserved hypothetical conserved membrane protein  94.28 
 
 		 367 aa  608  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2480  membrane protein  45.22 
 
 		 370 aa  285  8e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.404247  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0896  hypothetical protein  35.85 
 
 		 378 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.555033  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0892  hypothetical protein  35.74 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2331  hypothetical protein  31.89 
 
 		 376 aa  158  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2229  membrane protein-like protein  29.63 
 
 		 445 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.196783  hitchhiker  0.00236837 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2660  membrane protein-like protein  30.43 
 
 		 431 aa  74.7  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2356  membrane protein-like protein  24.89 
 
 		 442 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00121464  hitchhiker  0.00000680633 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1086  membrane protein-like protein  32.57 
 
 		 443 aa  70.5  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.166386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1895  hypothetical protein  26.12 
 
 		 416 aa  59.7  0.00000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1098  hypothetical protein  26.09 
 
 		 420 aa  55.8  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00466748  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1595  hypothetical protein  25.52 
 
 		 461 aa  52.8  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331924  normal  0.75872 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1298  membrane protein-like protein  31.06 
 
 		 312 aa  50.1  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1619  hypothetical protein  22.85 
 
 		 363 aa  49.7  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1592  hypothetical protein  25 
 
 		 354 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.644089 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1598  hypothetical protein  24.32 
 
 		 354 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1531  hypothetical protein  25 
 
 		 354 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4393  membrane protein  33.08 
 
 		 436 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.153723  normal  0.326438 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1363  hypothetical protein  27.05 
 
 		 703 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000334966  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2228  hypothetical protein  29.65 
 
 		 697 aa  42.7  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>