27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0760 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0760  NIPSNAP family containing protein  100 
 
 		 108 aa  224  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.302286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4475  hypothetical protein  67.59 
 
 		 108 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3412  NIPSNAP family protein  65.74 
 
 		 108 aa  158  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.870754  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1821  NIPSNAP family protein  66.67 
 
 		 108 aa  159  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3225  NIPSNAP family containing protein  65.74 
 
 		 108 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.990074  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2786  NIPSNAP  65.74 
 
 		 108 aa  154  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0225212  normal  0.675338 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2970  NIPSNAP family protein  54.63 
 
 		 108 aa  130  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0973  hypothetical protein  53.7 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155392  normal  0.712944 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5794  NIPSNAP family protein  52.78 
 
 		 108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0486998  normal  0.119522 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3255  NIPSNAP family protein  51.85 
 
 		 108 aa  124  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0089  NIPSNAP family containing protein  43.93 
 
 		 184 aa  90.5  7e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.348759  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0395  NIPSNAP family containing protein  33.64 
 
 		 262 aa  83.6  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.865859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5546  NIPSNAP family containing protein  29.81 
 
 		 105 aa  50.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0535  NIPSNAP family containing protein  28.57 
 
 		 267 aa  50.4  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.563369 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2212  NIPSNAP family protein  27.78 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00220241  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3219  NIPSNAP family protein  30.56 
 
 		 106 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20230  hypothetical protein  31.43 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2151  NIPSNAP family protein  29.81 
 
 		 102 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.341026 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5103  hypothetical protein  26.17 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6250  NIPSNAP family protein  32.47 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.441941 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5588  NIPSNAP family containing protein  27.62 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0968963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3119  NIPSNAP family protein  31.48 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2606  NIPSNAP family containing protein  31.48 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.288716  normal  0.0338124 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6545  NIPSNAP family containing protein  27.62 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344991  normal  0.706703 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0586  NIPSNAP family protein  27.62 
 
 		 106 aa  41.2  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6438  NIPSNAP family containing protein  27.78 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233973 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0611  NIPSNAP family containing protein  28.85 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>