25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5346 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5346  plasmid stabilization system  100 
 
 		 91 aa  180  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.461356 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5066  plasmid stabilization system  86.81 
 
 		 91 aa  161  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1683  plasmid stabilization system  69.23 
 
 		 91 aa  133  7.000000000000001e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.294502  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6449  plasmid stabilization system protein  72.53 
 
 		 86 aa  130  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254511  normal  0.305922 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4447  plasmid stabilization system  69.23 
 
 		 91 aa  128  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00132305  normal  0.136677 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5046  plasmid stabilization system  69.23 
 
 		 91 aa  128  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4337  plasmid stabilization system  69.23 
 
 		 91 aa  128  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.17652  normal  0.215547 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1735  plasmid stabilization system  69.23 
 
 		 91 aa  128  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.416669  normal  0.375673 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0093  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  62.64 
 
 		 91 aa  121  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00661999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0021  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  62.64 
 
 		 91 aa  121  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.941725  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0699  plasmid stabilization system protein  52.75 
 
 		 97 aa  109  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00627414  normal  0.782254 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0480  plasmid stabilization system protein  43.96 
 
 		 91 aa  85.9  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.414402 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2903  hypothetical protein  36.26 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000303437  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0585  hypothetical protein  31.87 
 
 		 93 aa  60.1  0.000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000997841  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0980  putative plasmid stabilization system protein  27.96 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.224479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0141  plasmid stabilization system  27.96 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.802306  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1217  plasmid stabilization system protein  29.35 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.745656  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4067  addiction module toxin, RelE/StbE family  28.57 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1455  plasmid stabilization system protein  26.19 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.421836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2718  addiction module antitoxin  32.95 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3491  plasmid stabilization system  28.57 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2625  plasmid stabilization system  28.57 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.111441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0573  plasmid stabilization system protein  31.4 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0309359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2193  plasmid stabilization system  28.57 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4586  addiction module antitoxin  30.68 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>