20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1797 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1797  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  441  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.71846  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1986  hypothetical protein  80.89 
 
 
225 aa  317  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0312653  hitchhiker  0.00472335 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4072  hypothetical protein  44.16 
 
 
254 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1869  hypothetical protein  41.79 
 
 
301 aa  94  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0215  hypothetical protein  40 
 
 
294 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3817  hypothetical protein  39.83 
 
 
294 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3629  hypothetical protein  41.04 
 
 
305 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0172  hypothetical protein  34.69 
 
 
561 aa  87.8  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0383324  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3210  hypothetical protein  39.82 
 
 
183 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.743942 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4579  hypothetical protein  33.82 
 
 
292 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.324475 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6197  hypothetical protein  35.29 
 
 
136 aa  52  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.558833  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3611  hypothetical protein  54.72 
 
 
281 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5578  hypothetical protein  55.77 
 
 
198 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3958  hypothetical protein  50.94 
 
 
274 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.161528 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2857  hypothetical protein  32.46 
 
 
312 aa  44.3  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.128156  normal  0.202978 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0776  hypothetical protein  40.91 
 
 
238 aa  44.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0833478  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0817  hypothetical protein  40.91 
 
 
238 aa  44.3  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.470186 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0005  hypothetical protein  29.75 
 
 
332 aa  43.5  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781712  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0738  hypothetical protein  44.64 
 
 
240 aa  43.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9105  hypothetical protein  34.67 
 
 
151 aa  43.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>