14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0571 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0571  putative thioesterase protein  100 
 
 
133 aa  273  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436095  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0612  putative thioesterase protein  81.2 
 
 
133 aa  230  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.618315  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0498  thioesterase superfamily protein  48.09 
 
 
133 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22351  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1002  hypothetical protein  38.64 
 
 
133 aa  106  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0257  thioesterase superfamily protein  29.55 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4678  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
136 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.88684 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2800  thioesterase superfamily protein  26.61 
 
 
138 aa  44.7  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.562988 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2382  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.47 
 
 
289 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715533  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  24.39 
 
 
136 aa  41.6  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3301  thioesterase superfamily protein  26.23 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3064  thioesterase superfamily protein  26.98 
 
 
136 aa  41.2  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.259385  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4734  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
138 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  27.12 
 
 
131 aa  40.8  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5390  thioesterase superfamily protein  27.5 
 
 
139 aa  40  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>