60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3476 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3476  17 kDa surface antigen  100 
 
 		 84 aa  160  7e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3565  17 kDa surface antigen  43.82 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.221572 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1625  hypothetical protein  41.1 
 
 		 175 aa  53.9  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.813311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0134  17 kDa surface antigen  54.55 
 
 		 257 aa  53.5  0.0000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.227874  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0151  hypothetical protein  54.55 
 
 		 257 aa  53.5  0.0000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1973  hypothetical protein  37.97 
 
 		 179 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126955  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1288  hypothetical protein  37.97 
 
 		 179 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1326  hypothetical protein  37.97 
 
 		 179 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000689224 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1311  hypothetical protein  37.97 
 
 		 179 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000260311 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2213  hypothetical protein  38.36 
 
 		 179 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2157  hypothetical protein  37.97 
 
 		 179 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013622 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01114  hypothetical protein  38.36 
 
 		 179 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2016  hypothetical protein  38.36 
 
 		 179 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246184 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2491  hypothetical protein  38.36 
 
 		 179 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000075989 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1927  hypothetical protein  43.48 
 
 		 178 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.339305  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01106  hypothetical protein  38.36 
 
 		 179 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1233  hypothetical protein  38.36 
 
 		 179 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1232  hypothetical protein  38.36 
 
 		 179 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0260587  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2537  17 kDa surface antigen  38.36 
 
 		 179 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.014281  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1490  hypothetical protein  42.03 
 
 		 179 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309897 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0918  17 kDa surface antigen  40.54 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1003  17 kDa surface antigen  40.54 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2673  surface antigen family protein  50 
 
 		 218 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110868  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2531  surface antigen family protein  50 
 
 		 218 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0265  surface antigen family protein  50 
 
 		 218 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1411  surface antigen family protein  50 
 
 		 218 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895937  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1607  surface antigen family protein  50 
 
 		 218 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.962323  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0228  hypothetical protein  50 
 
 		 218 aa  47.8  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.557986  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0957  SlyB protein  50 
 
 		 218 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3223  17 kDa surface antigen  51.16 
 
 		 272 aa  47.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.866673  normal  0.25243 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0511  hypothetical protein  50 
 
 		 208 aa  47.4  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5625  17 kDa surface antigen  53.49 
 
 		 215 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220709  normal  0.0159802 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0066  outer membrane lipoprotein  53.49 
 
 		 216 aa  46.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5451  17 kDa surface antigen  53.49 
 
 		 206 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349423  normal  0.317102 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4605  17 kDa surface antigen  53.49 
 
 		 216 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109506  hitchhiker  0.000338876 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5234  17 kDa surface antigen  53.49 
 
 		 215 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4902  17 kDa surface antigen  53.49 
 
 		 204 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0223  17 kDa surface antigen  55.88 
 
 		 269 aa  45.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1417  hypothetical protein  47.46 
 
 		 179 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1232  hypothetical protein  45 
 
 		 179 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.4462  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1170  17 kDa surface antigen  73.33 
 
 		 120 aa  44.7  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0164  17 kDa surface antigen  46.34 
 
 		 177 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14660  hypothetical protein  45.61 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1294  hypothetical protein  45.61 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2468  17 kDa surface antigen  60 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000341658  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04806  outer membrane protein  65 
 
 		 263 aa  42.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1377  surface antigen protein  38.81 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.113314  normal  0.0505694 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2052  hypothetical protein  54.29 
 
 		 155 aa  41.2  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000276746  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0840  17 kDa surface antigen  48.68 
 
 		 168 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0572265 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1308  17 kDa surface antigen  43.28 
 
 		 217 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0880  hypothetical protein  42.37 
 
 		 176 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0587539 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1890  17 kDa surface antigen  57.14 
 
 		 158 aa  40.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.219648  hitchhiker  0.0000108744 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4947  17 kDa surface antigen  88 
 
 		 181 aa  40.4  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0911907  normal  0.340805 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04299  17 kDa surface antigen family protein  41.18 
 
 		 126 aa  40.4  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2528  17 kDa surface antigen  52.94 
 
 		 158 aa  40.4  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000371225  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0769  17 kDa surface antigen  53.85 
 
 		 163 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.529266  normal  0.0236925 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0837  hypothetical protein  40.58 
 
 		 180 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262007  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3516  hypothetical protein  42.11 
 
 		 180 aa  40.4  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.672109 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4341  hypothetical protein  42.37 
 
 		 177 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.4665  hitchhiker  0.0000000405508 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0152  17 kDa surface antigen  54.84 
 
 		 294 aa  40.4  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>