22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2988 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2988  potential post-segregation antitoxin  100 
 
 		 79 aa  165  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2664  hypothetical protein  37.04 
 
 		 81 aa  61.6  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1256  post-segregation antitoxin CcdA  43.84 
 
 		 81 aa  60.8  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.643497  normal  0.197601 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1252  post-segregation antitoxin CcdA  38.36 
 
 		 93 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000539049  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3553  hypothetical protein  34.67 
 
 		 84 aa  56.6  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2487  Post-segregation antitoxin CcdA  36.99 
 
 		 82 aa  55.1  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0217  post-segregation antitoxin CcdA  38.67 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01830  CcdA protein  36 
 
 		 81 aa  53.5  0.0000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3184  post-segregation antitoxin CcdA  30.67 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.150063 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1731  Post-segregation antitoxin CcdA  35.62 
 
 		 82 aa  51.6  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7280  post-segregation antitoxin CcdA  30.56 
 
 		 80 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.427853  normal  0.0277353 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1554  post-segregation antitoxin CcdA  32.43 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1474  Post-segregation antitoxin CcdA  33.77 
 
 		 78 aa  47  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4519  hypothetical protein  29.73 
 
 		 76 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.40075  normal  0.09413 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3990  acetoacetyl-CoA synthase  36 
 
 		 81 aa  46.2  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.739311 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4238  hypothetical protein  38.24 
 
 		 73 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.131042  normal  0.541615 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1253  Post-segregation antitoxin CcdA  31.17 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4744  hypothetical protein  29.58 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0589295 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4793  hypothetical protein  29.58 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.954907  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4875  hypothetical protein  29.58 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.894566  hitchhiker  0.00893585 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4254  hypothetical protein  28.38 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0053  hypothetical protein  28.57 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.563576  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>