66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2801 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2801  lactoylglutathione lyase  100 
 
 		 169 aa  343  6e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.233135  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2133  lactoylglutathione lyase  85.44 
 
 		 163 aa  286  8e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2378  lactoylglutathione lyase  80 
 
 		 162 aa  271  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0300  lactoylglutathione lyase  81.94 
 
 		 158 aa  269  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00424343  normal  0.149575 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3777  lactoylglutathione lyase  79.22 
 
 		 156 aa  268  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.34023  normal  0.73054 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2168  lactoylglutathione lyase  82.35 
 
 		 156 aa  268  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.71915  normal  0.221606 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1139  lactoylglutathione lyase  78.98 
 
 		 158 aa  268  2.9999999999999997e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0160396  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2044  lactoylglutathione lyase  80.13 
 
 		 153 aa  261  3e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0204479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1854  lactoylglutathione lyase  80.13 
 
 		 153 aa  261  3e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1018  methylmalonyl-CoA epimerase  78.29 
 
 		 154 aa  255  2e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.898469 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2516  lactoylglutathione lyase  79.47 
 
 		 155 aa  253  1.0000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.345514  normal  0.625543 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3408  lactoylglutathione lyase  75.97 
 
 		 155 aa  248  4e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.17438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0914  lactoylglutathione lyase  75.33 
 
 		 155 aa  247  6e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2692  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  74.17 
 
 		 153 aa  246  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.208446 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0928  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  73.68 
 
 		 155 aa  243  8e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5323  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  67.97 
 
 		 158 aa  228  3e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46728  predicted protein  58.97 
 
 		 186 aa  200  6e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.115026  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1852  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.27 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0080  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.27 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0455  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.67 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.571993 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0916  methylmalonyl-CoA epimerase  27.78 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.311023 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3303  methylmalonyl-CoA epimerase  29.27 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000981467  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6000  methylmalonyl-CoA epimerase  27.03 
 
 		 143 aa  53.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0251153 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0571  methylmalonyl-CoA epimerase  27.27 
 
 		 137 aa  52.4  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82853e-18 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2285  methylmalonyl-CoA epimerase  29.51 
 
 		 140 aa  52  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000102737  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3258  methylmalonyl-CoA epimerase  30.08 
 
 		 134 aa  51.2  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000316472  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0306  methylmalonyl-CoA epimerase  27.27 
 
 		 141 aa  50.8  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1282  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.87 
 
 		 134 aa  50.8  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0230  methylmalonyl-CoA epimerase  33.33 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0558  methylmalonyl-CoA epimerase  29.13 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000977172  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0953  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.69 
 
 		 131 aa  50.4  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0254493 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0349  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.94 
 
 		 134 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0717499  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3321  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.15 
 
 		 128 aa  49.3  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2439  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.69 
 
 		 129 aa  48.5  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.509697 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2364  methylmalonyl-CoA epimerase  32.95 
 
 		 135 aa  47.8  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3253  methylmalonyl-CoA epimerase  27.05 
 
 		 134 aa  47.4  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000018375  hitchhiker  3.27573e-17 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2006  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.71 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4074  methylmalonyl-CoA epimerase  31.39 
 
 		 133 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0584893  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5865  methylmalonyl-CoA epimerase  27.46 
 
 		 136 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0290  methylmalonyl-CoA epimerase  26.02 
 
 		 133 aa  46.6  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0522  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.89 
 
 		 134 aa  46.6  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014865  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0655  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.12 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195436  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4223  methylmalonyl-CoA epimerase  30.66 
 
 		 133 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4198  methylmalonyl-CoA epimerase  30.66 
 
 		 134 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3770  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.41 
 
 		 133 aa  45.1  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0196484  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1623  methylmalonyl-CoA epimerase  36.51 
 
 		 136 aa  43.9  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1316  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.18 
 
 		 135 aa  43.9  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3939  methylmalonyl-CoA epimerase  26.03 
 
 		 156 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.368557  normal  0.0232297 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3163  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.69 
 
 		 128 aa  43.9  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3148  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0725  hypothetical protein  29.17 
 
 		 129 aa  43.9  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.542377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3197  methylmalonyl-CoA epimerase  27.46 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3865  methylmalonyl-CoA epimerase  26.03 
 
 		 156 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.241683  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1696  methylmalonyl-CoA epimerase  31.15 
 
 		 140 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.019096  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3851  methylmalonyl-CoA epimerase  25.34 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00602371 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1361  methylmalonyl-CoA epimerase  26.24 
 
 		 129 aa  43.1  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.7651e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2781  methylmalonyl-CoA epimerase  27.14 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4693  glyoxylase family protein  24.76 
 
 		 128 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.133333  hitchhiker  0.000000000000906955 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1488  methylmalonyl-CoA epimerase  34.92 
 
 		 134 aa  42.4  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.383789  normal  0.131397 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1167  methylmalonyl-CoA epimerase  29.55 
 
 		 135 aa  42  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.217696  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28560  methylmalonyl-CoA epimerase  24.83 
 
 		 153 aa  41.6  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.215327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1916  glyoxalase family protein  22.38 
 
 		 139 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3611  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.94 
 
 		 157 aa  41.6  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2339  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.06 
 
 		 168 aa  41.6  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.630848  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1289  lactoylglutathione lyase  26.67 
 
 		 137 aa  40.8  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09410  methylmalonyl-CoA epimerase  24.34 
 
 		 145 aa  40.8  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.990135  normal  0.273906 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>