17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0661 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0661  hypothetical protein  100 
 
 		 518 aa  1041    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0515751  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2400  hypothetical protein  39.96 
 
 		 523 aa  374  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.11617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2526  hypothetical protein  31.71 
 
 		 528 aa  172  1e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.215866  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0284  hypothetical protein  29.6 
 
 		 511 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3279  PEP-CTERM system associated protein  27.27 
 
 		 505 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0145  hypothetical protein  26.9 
 
 		 510 aa  91.3  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2508  PEP-CTERM system associated protein  26.84 
 
 		 513 aa  85.1  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.831651 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3506  hypothetical protein  25.17 
 
 		 495 aa  78.2  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000132371 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2389  hypothetical protein  23.83 
 
 		 472 aa  64.7  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1519  hypothetical protein  20.8 
 
 		 496 aa  61.2  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0398559  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2471  hypothetical protein  25.17 
 
 		 423 aa  56.6  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2361  hypothetical protein  27.27 
 
 		 418 aa  55.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1773  hypothetical protein  22.86 
 
 		 417 aa  54.3  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3116  hypothetical protein  26.09 
 
 		 543 aa  52.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.878878  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2474  PEP-CTERM system associated protein  22.14 
 
 		 417 aa  51.2  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1981  hypothetical protein  22.98 
 
 		 409 aa  48.5  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1982  hypothetical protein  28.28 
 
 		 501 aa  44.3  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>