28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3308 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3308  hypothetical protein  100 
 
 		 353 aa  732    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5378  GCN5-related N-acetyltransferase  52.63 
 
 		 363 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1528  hypothetical protein  37.32 
 
 		 354 aa  192  7e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2342  hypothetical protein  28.27 
 
 		 352 aa  162  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0275  hypothetical protein  34.81 
 
 		 350 aa  145  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2853  hypothetical protein  30.1 
 
 		 348 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.957178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3651  hypothetical protein  30.74 
 
 		 363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00669  hypothetical protein  29.71 
 
 		 331 aa  103  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2634  hypothetical protein  29.57 
 
 		 377 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0584962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0487  hypothetical protein  29.3 
 
 		 362 aa  100  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2330  hypothetical protein  28.07 
 
 		 335 aa  94.7  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.210198 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3120  hypothetical protein  27.92 
 
 		 329 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2976  hypothetical protein  27.92 
 
 		 329 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0503  hypothetical protein  25.27 
 
 		 354 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.180826  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4854  hypothetical protein  25.99 
 
 		 355 aa  70.9  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4739  hypothetical protein  23.77 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.08244  hitchhiker  0.000638889 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0390  hypothetical protein  25.4 
 
 		 342 aa  63.5  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1609  Methicillin resistance protein  26.87 
 
 		 347 aa  53.9  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1256  Methicillin resistance protein  23.7 
 
 		 347 aa  53.5  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000274445 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1415  methicillin resistance protein  29.05 
 
 		 366 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.89632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  28.3 
 
 		 366 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5671  hypothetical protein  20.73 
 
 		 293 aa  47.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.597001  normal  0.0100919 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0683  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  22.75 
 
 		 348 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0792  methicillin resistance protein  25.69 
 
 		 337 aa  47.8  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  22.78 
 
 		 363 aa  47.8  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2369  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  25.71 
 
 		 368 aa  46.2  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0961  methicillin resistance protein  28.35 
 
 		 359 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  24.16 
 
 		 335 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>