More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1856 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1260  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  71.28 
 
 		 491 aa  672    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0291  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  70.55 
 
 		 487 aa  683    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1620  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  75.66 
 
 		 489 aa  735    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.690045 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1429  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  88.09 
 
 		 487 aa  885    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0657932  normal  0.0240553 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2061  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  74.85 
 
 		 489 aa  721    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0144949 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39730  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  69.88 
 
 		 489 aa  647    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239623  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1453  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  67.56 
 
 		 486 aa  654    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.136087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1306  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  88.91 
 
 		 487 aa  887    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24376  normal  0.894393 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1449  inosine-5-monophosphate dehydrogenase  68.44 
 
 		 489 aa  644    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327774  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1524  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  80.29 
 
 		 486 aa  802    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.048391  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1688  hypothetical protein  65.85 
 
 		 490 aa  680    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1687  hypothetical protein  65.85 
 
 		 490 aa  681    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1261  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  68.44 
 
 		 489 aa  649    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2338  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  74.23 
 
 		 487 aa  736    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.879992  normal  0.100057 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2001  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  70.76 
 
 		 489 aa  697    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.488937 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1856  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  100 
 
 		 487 aa  984    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1246  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  72.3 
 
 		 491 aa  722    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1752  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  72.07 
 
 		 486 aa  699    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.853386 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1893  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  80.29 
 
 		 486 aa  800    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0489208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2549  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  80.29 
 
 		 486 aa  802    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.425317  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0613  IMP dehydrogenase  68.79 
 
 		 486 aa  700    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000830235  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4588  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  68.44 
 
 		 489 aa  650    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1532  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  64.81 
 
 		 485 aa  647    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5301  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  80.7 
 
 		 486 aa  803    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.446018  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2761  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  72.07 
 
 		 489 aa  689    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0609  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  69.2 
 
 		 486 aa  686    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.050446  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3486  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  69.06 
 
 		 489 aa  678    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1616  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  64.34 
 
 		 486 aa  644    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1295  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  80.29 
 
 		 486 aa  802    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1200  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  70.23 
 
 		 486 aa  712    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.608786  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00905  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  65.91 
 
 		 485 aa  655    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0297709  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2056  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  80.49 
 
 		 486 aa  801    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2457  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  80.29 
 
 		 486 aa  802    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195801  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2405  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  80.29 
 
 		 486 aa  802    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.323419  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1682  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  67.08 
 
 		 514 aa  656    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.155444  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1589  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  64.81 
 
 		 485 aa  647    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2288  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  70.99 
 
 		 489 aa  714    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.453935  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1459  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  66.19 
 
 		 556 aa  655    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2011  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  80.49 
 
 		 486 aa  799    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1141  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  74.74 
 
 		 486 aa  751    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.144187 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2440  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  73.42 
 
 		 489 aa  722    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1706  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  79.67 
 
 		 486 aa  797    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0529  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  81.11 
 
 		 487 aa  825    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1461  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  96.3 
 
 		 487 aa  950    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2431  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  80.08 
 
 		 486 aa  799    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.171445 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1285  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  80.29 
 
 		 486 aa  783    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0259426  normal  0.434243 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2024  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  80.29 
 
 		 486 aa  802    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.637626  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1370  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  88.71 
 
 		 487 aa  887    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.810739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6086  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  80.49 
 
 		 486 aa  802    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2623  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  73.25 
 
 		 487 aa  730    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3287  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  80.29 
 
 		 486 aa  802    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00821787  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1014  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  69.88 
 
 		 488 aa  674    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1777  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  67.56 
 
 		 486 aa  654    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.814385  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2024  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  80.08 
 
 		 486 aa  798    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.363824  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1423  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  81.31 
 
 		 487 aa  811    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1728  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  67.9 
 
 		 494 aa  661    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.716764  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1991  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  80.49 
 
 		 486 aa  802    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.287012  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3008  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  70.47 
 
 		 491 aa  688    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0175212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1035  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  68.79 
 
 		 486 aa  654    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3370  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  73.42 
 
 		 489 aa  735    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1670  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  66.19 
 
 		 485 aa  648    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0531396  normal  0.274941 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4194  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  68.65 
 
 		 489 aa  634    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2548  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  71.28 
 
 		 491 aa  672    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685528 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1913  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  68.79 
 
 		 486 aa  657    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1314  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  79.47 
 
 		 486 aa  806    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1031  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  68.44 
 
 		 489 aa  633  1e-180  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4148  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  63.73 
 
 		 488 aa  632  1e-180  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0201579  normal  0.112689 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1360  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  62.32 
 
 		 490 aa  632  1e-180  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1071  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  68.44 
 
 		 489 aa  633  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1029  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  68.44 
 
 		 489 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1005  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  62.32 
 
 		 490 aa  632  1e-180  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0730  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  64.61 
 
 		 489 aa  625  1e-178  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3120  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  62.58 
 
 		 489 aa  626  1e-178  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.899033  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1261  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  62.04 
 
 		 490 aa  622  1e-177  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.289977  normal  0.031693 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1346  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  66.8 
 
 		 489 aa  621  1e-177  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43014  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15310  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  66.8 
 
 		 489 aa  621  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.10306  hitchhiker  4.2499e-17 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1137  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  61.19 
 
 		 488 aa  616  1e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00151864  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2646  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  62.47 
 
 		 488 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0420  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.37 
 
 		 487 aa  613  9.999999999999999e-175  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2195  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  62.14 
 
 		 491 aa  608  1e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4242  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  62.17 
 
 		 490 aa  608  1e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953996  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3293  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  62.06 
 
 		 488 aa  608  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1615  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.54 
 
 		 487 aa  608  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1234  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  62.27 
 
 		 488 aa  610  1e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1235  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  62.27 
 
 		 488 aa  611  1e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.916768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1520  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.33 
 
 		 487 aa  605  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0307442  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1305  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  62.06 
 
 		 488 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0296  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  59.55 
 
 		 489 aa  608  9.999999999999999e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1495  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.12 
 
 		 489 aa  604  1.0000000000000001e-171  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.939383  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2999  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  61.44 
 
 		 488 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1431  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  60.12 
 
 		 489 aa  603  1.0000000000000001e-171  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2349  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  61.33 
 
 		 487 aa  604  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163967  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2984  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  61.44 
 
 		 488 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3142  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  61.44 
 
 		 488 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.269643 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1559  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  60.16 
 
 		 490 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.554921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2359  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  62.06 
 
 		 488 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.885257 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1217  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  59.34 
 
 		 491 aa  598  1e-170  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1379  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  61.24 
 
 		 488 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.281369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1269  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  61.03 
 
 		 488 aa  599  1e-170  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000336634  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1297  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  61.03 
 
 		 488 aa  598  1e-170  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.724136  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>