30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1616 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1616  iron-sulfur cluster-binding protein  100 
 
 		 228 aa  467  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1205  hypothetical protein  41.2 
 
 		 221 aa  188  5e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3274  iron-sulfur cluster-binding protein  43.06 
 
 		 220 aa  182  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0807289 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3512  hypothetical protein  44.19 
 
 		 223 aa  182  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0582986  normal  0.284426 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2147  oxidoreductase FAD-binding subunit  39.53 
 
 		 562 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2641  iron-sulfur cluster-binding protein  39.53 
 
 		 599 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2802  hypothetical protein  44.13 
 
 		 219 aa  175  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3188  ferredoxin  39.07 
 
 		 588 aa  174  7e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4908  hypothetical protein  44.34 
 
 		 219 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1070  AIG2 family protein  33.52 
 
 		 330 aa  87.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.739308 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0733  methionine aminopeptidase, type I  31.25 
 
 		 271 aa  48.5  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.801618  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0968  methionine aminopeptidase  24.87 
 
 		 283 aa  47.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.940482  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1074  methionine aminopeptidase, type I  30.69 
 
 		 257 aa  47.4  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3118  methionine aminopeptidase, type I  23.28 
 
 		 270 aa  45.8  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0559112  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1588  methionine aminopeptidase, type I  22.27 
 
 		 292 aa  45.4  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000312682 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1797  hypothetical protein  28.05 
 
 		 291 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1319  methionine aminopeptidase, type I  22.08 
 
 		 285 aa  44.3  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.123772  normal  0.0982705 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1273  methionine aminopeptidase  28.46 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65111  normal  0.766609 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1512  methionine aminopeptidase  28.19 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1589  methionine aminopeptidase, type I  22.27 
 
 		 303 aa  43.9  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.355679  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13460  methionine aminopeptidase, type I  24.12 
 
 		 314 aa  43.1  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.752514  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2156  methionine aminopeptidase, type I  25.3 
 
 		 268 aa  42.7  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0942578  normal  0.307314 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3209  methionine aminopeptidase, type I  23.98 
 
 		 285 aa  42.7  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.836059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1760  methionine aminopeptidase, type I  26.76 
 
 		 267 aa  42.4  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.508465 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1245  methionine aminopeptidase  21.81 
 
 		 282 aa  42.4  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.476436  normal  0.0508409 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0856  methionine aminopeptidase  22.44 
 
 		 266 aa  42  0.008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2033  methionine aminopeptidase  23.4 
 
 		 285 aa  41.6  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.081264 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3793  methionine aminopeptidase, type I  26.62 
 
 		 276 aa  41.6  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0861362  unclonable  0.000000166393 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2096  methionine aminopeptidase  23.4 
 
 		 285 aa  41.6  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0670638  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2050  methionine aminopeptidase  23.4 
 
 		 285 aa  41.6  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.208724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>