53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0964 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0964  putative bacteriophage transcriptional activator-related transcription regulator protein  100 
 
 		 73 aa  147  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.809217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2195  Phage transcriptional activator, Ogr/Delta  80.3 
 
 		 97 aa  118  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3117  transcriptional activator Ogr/delta  77.27 
 
 		 88 aa  110  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4868  transcriptional activator Ogr/delta  51.72 
 
 		 82 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.547602  normal  0.181017 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1904  putative transcriptional activator transcription regulator protein  47.37 
 
 		 82 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00444501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0173  transcriptional activator Ogr/delta  50 
 
 		 82 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2617  transcriptional activator Ogr/delta  46.55 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00204522  hitchhiker  0.000000000237412 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2583  transcriptional activator Ogr/delta  46.55 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000206926  hitchhiker  0.0000460899 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1628  transcriptional activator Ogr/delta  46.55 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.350137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0741  putative phage zinc-binding transcriptional activator  40 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2939  zinc-finger protein  44.78 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  decreased coverage  6.930430000000001e-29 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1360  phage transcriptional activator, Ogr/delta  52.08 
 
 		 71 aa  53.9  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2106  transcriptional activator Ogr/delta  46.43 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0144545  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2888  transcriptional activator Ogr/delta  39.71 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0949  phage transcriptional activator, Ogr/Delta  44.64 
 
 		 72 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.429231  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00851  prophage P2 OGR-like protein  44.64 
 
 		 83 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0237  transcriptional activator Ogr/delta  39.71 
 
 		 80 aa  51.2  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000439463  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2750  transcriptional activator Ogr/delta  44.64 
 
 		 72 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364612 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2486  phage transcriptional activator, Ogr/Delta  44.64 
 
 		 72 aa  51.2  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00857  hypothetical protein  44.64 
 
 		 83 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2802  zinc-finger protein  44.23 
 
 		 89 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1475  phage transcriptional activator, Ogr/delta  42.62 
 
 		 79 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0527212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2306  transcriptional activator Ogr/delta  42.86 
 
 		 71 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.580847  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2353  transcriptional activator Ogr/delta  42.86 
 
 		 71 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1808  transcriptional activator Ogr/delta  39.13 
 
 		 63 aa  50.8  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000910407  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2194  phage transcriptional activator, Ogr/Delta  42.86 
 
 		 71 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0856  transcriptional activator Ogr/delta  42.42 
 
 		 72 aa  48.9  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000414293  hitchhiker  0.000248698 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05018  hypothetical protein  40 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1361  hypothetical protein  36.51 
 
 		 87 aa  47.4  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1278  phage transcriptional activator, Ogr/delta  39.39 
 
 		 82 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0718  phage transcriptional activator, Ogr/delta  41.67 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0220217 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0718  transcriptional activator Ogr/delta  40 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1733  phage transcriptional activator, Ogr/delta  42.86 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000208403  normal  0.718201 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3704  transcriptional activator Ogr/delta  42.86 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.04056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0358  phage transcriptional activator Ogr/delta  44.23 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4132  hypothetical protein  42.86 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1860  transcriptional activator Ogr/delta  41.07 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0672856  normal  0.0226752 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0895  transcriptional activator Ogr/delta  38.46 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.646461  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2956  phage transcriptional activator, Ogr/delta  42.37 
 
 		 81 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000761798 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2769  phage transcriptional activator, Ogr/delta  41.38 
 
 		 80 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.278918  normal  0.680282 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3277  transcriptional activator Ogr/delta  36.36 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3475  DNA-binding transcriptional regulator  40.58 
 
 		 72 aa  43.9  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100837  normal  0.103795 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3104  phage transcriptional activator, Ogr/delta  36.25 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.203632 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3023  DNA-binding transcriptional regulator  41.67 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0341467 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0050  transcriptional activator Ogr/delta  39.51 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4151  putative transcriptional regulator  36.21 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.202641  normal  0.022006 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3199  transcriptional activator Ogr/delta  35.29 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00001944  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4352  DNA-binding transcriptional regulator  41.67 
 
 		 72 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.481473 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0999  DNA-binding transcriptional regulator  41.67 
 
 		 72 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.603449  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0692  phage transcriptional activator, Ogr/delta  39.68 
 
 		 81 aa  42  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2666  transcriptional activator Ogr/delta  36.73 
 
 		 80 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.058976  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1574  transcriptional activator Ogr/delta  41.67 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1024  phage zinc-binding transcriptional activator  35.09 
 
 		 154 aa  40  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>