More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3060 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3788  hexapaptide repeat-containing transferase  99.44 
 
 		 218 aa  356  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.239622 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3060  O-acetylserine synthase  100 
 
 		 177 aa  353  5e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.950914  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  81.61 
 
 		 192 aa  299  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.597349  normal  0.536069 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5293  serine O-acetyltransferase  37.79 
 
 		 177 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3942  serine O-acetyltransferase  32.93 
 
 		 238 aa  100  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4614  Serine O-acetyltransferase  39.53 
 
 		 258 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0811  serine O-acetyltransferase  38.32 
 
 		 250 aa  93.6  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000161338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4306  serine O-acetyltransferase  38.86 
 
 		 202 aa  92.8  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2873  Serine O-acetyltransferase  35.29 
 
 		 273 aa  92  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.78055  hitchhiker  0.0000000230689 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0828  serine O-acetyltransferase  38.29 
 
 		 275 aa  92.4  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2061  Serine O-acetyltransferase  38.73 
 
 		 268 aa  91.7  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.145784  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1841  transferase hexapeptide repeat containing protein  33.53 
 
 		 173 aa  91.7  5e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.520289  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2188  serine O-acetyltransferase  38.89 
 
 		 280 aa  91.7  5e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1297  serine acetyltransferase  38.01 
 
 		 258 aa  91.3  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2262  serine acetyltransferase  34.27 
 
 		 273 aa  90.9  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14700  serine O-acetyltransferase  38.82 
 
 		 258 aa  90.9  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.74383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1737  serine O-acetyltransferase  34.27 
 
 		 273 aa  90.5  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000134681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1817  serine O-acetyltransferase  34.27 
 
 		 273 aa  90.5  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000171245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2282  serine O-acetyltransferase  34.27 
 
 		 273 aa  90.5  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000478112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2719  serine O-acetyltransferase  34.52 
 
 		 174 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.395026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2578  Serine acetyltransferase-like protein  35.33 
 
 		 174 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0951  serine O-acetyltransferase  36.11 
 
 		 191 aa  90.1  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0852  serine O-acetyltransferase  37.01 
 
 		 252 aa  89.4  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2399  serine O-acetyltransferase  33.71 
 
 		 273 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000148816  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2909  serine O-acetyltransferase  35.71 
 
 		 174 aa  89  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2504  serine O-acetyltransferase  33.71 
 
 		 273 aa  88.6  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000959459  normal  0.0292535 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3136  serine O-acetyltransferase, putative  35.33 
 
 		 174 aa  89  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.901166  normal  0.226226 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1774  serine O-acetyltransferase  36.47 
 
 		 273 aa  88.6  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0396638  hitchhiker  0.00060265 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0129  Serine O-acetyltransferase  37.58 
 
 		 247 aa  88.6  4e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.192527  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1959  serine O-acetyltransferase  33.71 
 
 		 273 aa  88.6  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000137808  hitchhiker  0.00459897 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1110  serine O-acetyltransferase  41.29 
 
 		 225 aa  88.6  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0265752  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2426  serine O-acetyltransferase  36.99 
 
 		 273 aa  88.6  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.563474  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2388  serine O-acetyltransferase  33.71 
 
 		 273 aa  88.6  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000558111  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2151  serine O-acetyltransferase  34.27 
 
 		 273 aa  88.2  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00432813  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1162  serine O-acetyltransferase  36.97 
 
 		 252 aa  87.8  6e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254376  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0840  serine O-acetyltransferase  36.42 
 
 		 261 aa  87.4  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0082  serine O-acetyltransferase  36.36 
 
 		 248 aa  87.4  9e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0870  serine O-acetyltransferase  36.42 
 
 		 261 aa  87.4  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.239622 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0883  serine O-acetyltransferase  35.84 
 
 		 261 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.25583  hitchhiker  0.00547616 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0673  serine O-acetyltransferase  35.19 
 
 		 182 aa  87  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0541501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0192  serine O-acetyltransferase  37.04 
 
 		 229 aa  86.7  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4338  serine O-acetyltransferase  35.43 
 
 		 261 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.790594  hitchhiker  0.000000000213243 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1130  serine O-acetyltransferase  36.57 
 
 		 269 aa  85.5  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3513  serine O-acetyltransferase  36.63 
 
 		 261 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.599692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1120  serine O-acetyltransferase  39.04 
 
 		 259 aa  85.1  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1830  serine acetyltransferase  38.12 
 
 		 249 aa  85.1  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.436553  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0402  serine O-acetyltransferase  38.27 
 
 		 229 aa  85.1  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000226719  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6429  hexapaptide repeat-containing transferase  32.76 
 
 		 191 aa  85.1  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0556952  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1486  serine O-acetyltransferase  35.15 
 
 		 273 aa  84.7  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.517534  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1670  serine O-acetyltransferase  36.05 
 
 		 194 aa  84.3  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.390403  normal  0.48751 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0954  Serine O-acetyltransferase  31.41 
 
 		 175 aa  84.3  7e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1421  serine O-acetyltransferase  35.8 
 
 		 258 aa  84.3  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40420  Serine O-acetyltransferase  36.93 
 
 		 259 aa  84  9e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3325  serine O-acetyltransferase  39.6 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148929  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1006  serine O-acetyltransferase  31.95 
 
 		 173 aa  84  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1291  Serine O-acetyltransferase  33.71 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.147219  normal  0.0151136 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3618  serine O-acetyltransferase  33.33 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0392329 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1456  serine O-acetyltransferase  36.21 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000250331  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4132  serine O-acetyltransferase  35.12 
 
 		 288 aa  83.2  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2319  serine O-acetyltransferase  34.32 
 
 		 273 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0101621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1260  serine O-acetyltransferase  35.29 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000272502  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1235  Serine O-acetyltransferase  34.48 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.377019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2485  serine O-acetyltransferase  39.87 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000105087  normal  0.0192954 
 
 
-
 
NC_002936  DET1588  serine O-acetyltransferase  38.41 
 
 		 230 aa  82  0.000000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1647  Serine O-acetyltransferase  35.63 
 
 		 258 aa  82  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.421596  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1862  serine O-acetyltransferase  37.67 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  9.89239e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1794  serine O-acetyltransferase  37.72 
 
 		 262 aa  82  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.837639  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1236  serine O-acetyltransferase  34.66 
 
 		 267 aa  82  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00306075  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1807  serine O-acetyltransferase  38.26 
 
 		 245 aa  81.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.705763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1779  serine O-acetyltransferase  38.26 
 
 		 245 aa  81.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1293  serine acetyltransferase CysE, putative  34.16 
 
 		 180 aa  81.6  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1162  O-acetylserine synthase  38.42 
 
 		 268 aa  81.3  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.973633  normal  0.323446 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2102  serine O-acetyltransferase  38.29 
 
 		 257 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.348935 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1097  serine O-acetyltransferase  38.18 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.486928 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24440  serine O-acetyltransferase  33.86 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.54097 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2125  serine O-acetyltransferase  35.63 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.324489 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0845  serine O-acetyltransferase  35.26 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000173801  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01353  serine acetyltransferase  34.93 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000779312  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0820  serine O-acetyltransferase  37.58 
 
 		 264 aa  80.5  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0119885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0169  serine O-acetyltransferase  32.04 
 
 		 175 aa  80.5  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000824701  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0177  serine O-acetyltransferase  34.86 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.635275  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2208  serine O-acetyltransferase  35.8 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.18753  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1012  transferase hexapeptide repeat containing protein  31.14 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0051386  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0294  Serine acetyltransferase-like protein  33.71 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394736  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2515  serine O-acetyltransferase  38.24 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0135157  hitchhiker  0.0000144493 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0671  serine O-acetyltransferase  38.67 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.808463  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0085  serine O-acetyltransferase  35.8 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1135  serine O-acetyltransferase  35.8 
 
 		 253 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1165  serine O-acetyltransferase  35.8 
 
 		 253 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.701268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1003  serine O-acetyltransferase  38.18 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.169467  normal  0.127714 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2196  serine O-acetyltransferase  36.31 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000019426 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0089  serine O-acetyltransferase  35.8 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000290545  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1047  serine O-acetyltransferase  32.76 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0269774 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0965  serine O-acetyltransferase  32.76 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.305959  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1198  serine O-acetyltransferase  35.68 
 
 		 280 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0792406 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0397  serine O-acetyltransferase  34.29 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000026222  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3107  serine O-acetyltransferase  37.64 
 
 		 253 aa  78.6  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000903584  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1733  Serine O-acetyltransferase  34.97 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0102329  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1246  serine O-acetyltransferase  36.52 
 
 		 280 aa  78.6  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1824  serine O-acetyltransferase  31.1 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.336838  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>